Basic Information

Symbol
DUSP18
RNA class
mRNA
Alias
Dual Specificity Phosphatase 18 DUSP20 Low Molecular Weight Dual Specificity Phosphatase 20 Dual Specificity Protein Phosphatase 18 LMWDSP20 EC 3.1.3.16 EC 3.1.3.48 LMW-DSP20 DSP18
Location (GRCh38)
22:30652051-30667887
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152511.5
Sequence length
3050.0 nt
GC content
0.5046

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1032.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1085.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1005.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001304794.2 NCBI
AGAGCCCGGGCGGCUACGGAAGCGGUGAGACUGUCUCUCGGCUGCAGCC… 3217 nt 0.5085
NM_001304795.2 NCBI
AGAGCCCGGGCGGCUACGGAAGCGGUGAGACUGUCUCUCGGCUGCAGCC… 1338 nt 0.5732
NM_001304796.2 NCBI
AGAGCCCGGGCGGCUACGGAAGCGGUGAGACUGUCUCUCGGCUGCAGCC… 2940 nt 0.5054
NM_152511.5 NCBI
AGAGCCCGGGCGGCUACGGAAGCGGUGAGACUGUCUCUCGGCUGCAGCC… 3050 nt 0.5046
Summary

Dual-specificity phosphatases (DUSPs) constitute a large heterogeneous subgroup of the type I cysteine-based protein-tyrosine phosphatase superfamily. DUSPs are characterized by their ability to dephosphorylate both tyrosine and serine/threonine residues. They have been implicated as major modulators of critical signaling pathways. DUSP18 contains the consensus DUSP C-terminal catalytic domain but lacks the N-terminal CH2 domain found in the MKP (mitogen-activated protein kinase phosphatase) class of DUSPs (see MIM 600714) (summary by Patterson et al., 2009 [PubMed 19228121]).[supplied by OMIM, Dec 2009]

Forensic Context

A study in humans identified the DUSP18 as a top differentially expressed gene when comparing the 7-day and 3-month post-acute myocardial infarction stages, and it showed a strong correlation (coefficient ≥0.8) with the metabolite HMDB0259626 [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3].