Basic Information

Symbol
DUT
RNA class
mRNA
Alias
Deoxyuridine Triphosphatase DUTPase DUTP Pyrophosphatase Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase, Mitochondrial DUTP Diphosphatase EC 3.6.1.23 DUTP Nucleotidohydrolase BMFDMS
Location (GRCh38)
15:48331011-48343373
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001025248.2
Sequence length
2141.0 nt
GC content
0.4414

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-671.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -711.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 576.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001025248.2 NCBI
GUUCCCAGGACGGGCGCGUCUUCAGGGUGGAAGCCUGGCGCACGUCCGG… 2141 nt 0.4414
NM_001025249.1 NCBI
GUCAUGUUCCCAGGACGGGCGCGUCUUCAGGGUGGAAGCCUGGCGCACG… 1830 nt 0.3929
NM_001330286.2 NCBI
GCAAUAACUGUCACCGGCGCCGAGAUGCGGUUCCGGCGCUUAGGGCGCC… 1871 nt 0.3998
NM_001948.4 NCBI
AUCGUGCGCUCUCCUCUUCCCCCGGUGGUCUCCUCGCUCGCCUUCUGGC… 1845 nt 0.3940
Summary

This gene encodes an essential enzyme of nucleotide metabolism. The encoded protein forms a ubiquitous, homotetrameric enzyme that hydrolyzes dUTP to dUMP and pyrophosphate. This reaction serves two cellular purposes: providing a precursor (dUMP) for the synthesis of thymine nucleotides needed for DNA replication, and limiting intracellular pools of dUTP. Elevated levels of dUTP lead to increased incorporation of uracil into DNA, which induces extensive excision repair mediated by uracil glycosylase. This repair process, resulting in the removal and reincorporation of dUTP, is self-defeating and leads to DNA fragmentation and cell death. Alternative splicing of this gene leads to different isoforms that localize to either the mitochondrion or nucleus. A related pseudogene is located on chromosome 19. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.