Basic Information

Symbol
DXO
RNA class
mRNA
Alias
Decapping Exoribonuclease DOM3L DOM3Z Decapping And Exoribonuclease Protein NAD-Capped RNA Hydrolase DXO 5'-3' Exoribonuclease DXO DeNADding Enzyme DXO NG6 DOM-3 (C. Elegans) Homolog Z Dom-3 Homolog Z (C. Elegans) Dom-3 Homolog Z Protein Dom3Z EC 3.1.13.- EC 3.6.1.- RAI1
Location (GRCh38)
6:31969810-31972509
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005510.4
Sequence length
1469.0 nt
GC content
0.5827

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-581.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -606.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 344.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371205.1 NCBI
GUUGGCGGCGUGGAGGGGCGCCGGUGGCCACGUUGGUGUCAACCUCCUU… 1527 nt 0.5802
NM_001371206.1 NCBI
GUUGGCGGCGUGGAGGGGCGCCGGUGGCCACGUUGGUGUCAACCUCCUU… 1369 nt 0.5829
NM_005510.4 NCBI
GUUGGCGGCGUGGAGGGGCGCCGGUGGCCACGUUGGUGUCAACCUCCUU… 1469 nt 0.5827
Summary

This gene localizes to the major histocompatibility complex (MHC) class III region on chromosome 6. The function of its protein product is unknown, but its ubiquitous expression and conservation in both simple and complex eukaryotes suggests that this may be a housekeeping gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DXO was upregulated in the ileum of methamphetamine-treated animals compared to saline-treated controls, as identified through RNA sequencing and validated by qPCR, and its gene is located near SNPs associated with inflammatory bowel disease [Sun et al. DOI:10.21037/Atm-20-7741].