Basic Information

Symbol
AGO2
RNA class
mRNA
Alias
Argonaute RISC Catalytic Component 2 LINC00980 EIF2C2 Q10 Cancer Susceptibility Candidate 7 (Non-Protein Coding) Eukaryotic Translation Initiation Factor 2C, 2 PAZ Piwi Domain Protein Protein Argonaute-2 Protein Slicer HAGO2 CASC7 PPD Eukaryotic Translation Initiation Factor 2C 2 Long Intergenic Non-Protein Coding RNA 980 Argonaute 2, RISC Catalytic Component EC 3.1.26.N2 EC 3.1.26.N1 Argonaute 2 Argonaute2 EIF-2C 2 LESKRES EIF2C 2 HAgo2
Location (GRCh38)
8:140520156-140635633
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012154.5
Sequence length
14595.0 nt
GC content
0.4664

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4675.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164623.3 NCBI
CUGUUUGGCGAGGCGGCCGCGCCGGGGCGGAUCGUGCGGCCGGCGGCUC… 14493 nt 0.4659
NM_012154.5 NCBI
CUGUUUGGCGAGGCGGCCGCGCCGGGGCGGAUCGUGCGGCCGGCGGCUC… 14595 nt 0.4664
Summary

This gene encodes a member of the Argonaute family of proteins which play a role in RNA interference. The encoded protein is highly basic, and contains a PAZ domain and a PIWI domain. It may interact with dicer1 and play a role in short-interfering-RNA-mediated gene silencing. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the AGO2 is degraded by miR-671 via AGO2, and its knockout leads to decreased miR-7, increased miR-671, elevated levels of miR-7 targets, and excitatory/behavioral phenotypes [Patop et al. DOI:10.15252/embj.2018100836]. In the context of miRNA function, AGO2 uniquely mediates cleavage of extensively paired targets and is a central component of the RNA-induced silencing complex (RISC) [Shang et al. DOI:10.1038/s41576-023-00611-y]. A study in mice demonstrated that the AGO2 mRNA was up-regulated 2.63-fold in bone marrow cells 6 hours after a 6.5 Gy whole-body ionizing radiation exposure, as identified through microarray analysis [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389].