Basic Information

Symbol
DYNC2I1
RNA class
mRNA
Alias
Dynein 2 Intermediate Chain 1 CFAP163 FAP163 WDR60 DIC6 Cytoplasmic Dynein 2 Intermediate Chain 1 WD Repeat-Containing Protein 60 WD Repeat Domain 60 FLJ10300 Testicular Secretory Protein Li 66 SRPS6 SRTD8
Location (GRCh38)
7:158856558-158956747
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018051.5
Sequence length
3789.0 nt
GC content
0.4838

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1190.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1255.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 743.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001350914.2 NCBI
GCAAAACCUAAAGAGGAUGCUAAUAUGACUCCAUAACAGCUGACUGCAA… 3850 nt 0.4668
NM_001350915.2 NCBI
GGGAGAGGCCGCAGGGCACGCUGGGCAGUGCUUCUGGGCCCUCUGCUGC… 3733 nt 0.4838
NM_001350916.2 NCBI
GGGAGAGGCCGCAGGGCACGCUGGGCAGUGCUUCUGGGCCCUCUGCUGC… 3686 nt 0.4845
NM_001350917.2 NCBI
GGGAGAGGCCGCAGGGCACGCUGGGCAGUGCUUCUGGGCCCUCUGCUGC… 3907 nt 0.4850
NM_001350918.2 NCBI
GGGAGAGGCCGCAGGGCACGCUGGGCAGUGCUUCUGGGCCCUCUGCUGC… 4026 nt 0.4871
NM_018051.5 NCBI
GGGAGAGGCCGCAGGGCACGCUGGGCAGUGCUUCUGGGCCCUCUGCUGC… 3789 nt 0.4838
Summary

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD) and may facilitate the formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. Members of this family are involved in a variety of cellular processes including cell cycle progression, signal transduction, apoptosis, and gene regulation. The encoded protein contains four WD repeats and may play a role in the formation of cilia. Mutations in this gene have been associated with short-rib polydactyly and Jeune syndromes. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the DYNC2I1 as a top SIG (sustained increasing gene) with expression that increased from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury), classifying it as a biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].