Basic Information

Symbol
E2F3
RNA class
mRNA
Alias
E2F Transcription Factor 3 Transcription Factor E2F3 E2F-3 KIAA0075
Location (GRCh38)
6:20401847-20493714
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001949.5
Sequence length
5036.0 nt
GC content
0.4631

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1621.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1716.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1269.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243076.3 NCBI
ACUUCCUCCUGCUCGCCGGCUCCCUGGCCUGGGACGGUCCCGGCGCCCU… 4490 nt 0.4445
NM_001949.5 NCBI
AUUCAUUGUCAGCAGCAGCUUCCUGGAGCCAUUUUUCAGCUGCCGGCCG… 5036 nt 0.4631
Summary

This gene encodes a member of a small family of transcription factors that function through binding of DP interaction partner proteins. The encoded protein recognizes a specific sequence motif in DNA and interacts directly with the retinoblastoma protein (pRB) to regulate the expression of genes involved in the cell cycle. Altered copy number and activity of this gene have been observed in a number of human cancers. There are pseudogenes for this gene on chromosomes 2 and 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the transcription factor E2F3a in the nucleus accumbens is a key regulator of cocaine action, where its overexpression enhanced cocaine-induced locomotor sensitization and conditioned place preference while its knockdown blunted these behaviors [Cates et al. DOI:10.1016/j.biopsych.2017.11.027].