Basic Information

Symbol
E2F5
RNA class
mRNA
Alias
E2F Transcription Factor 5 E2F Transcription Factor 5, P130-Binding Transcription Factor E2F5 E2F-5
Location (GRCh38)
8:85177154-85217158
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001951.4
Sequence length
1964.0 nt
GC content
0.4695

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-626.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -664.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 649.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((.(((((((((((.(((((.((((((.....)))))).....)))))...)))))))))((((((((.((((.......(((.(((.(.(.(((((((.(((.((.((((((((((((((.((.(((.((..(((((....(((((...))))))))))...))))).)).))))).......))))))))))).)))((((((.((.(((.((....)).)))..)).)))).)).))))))))).))).)))...((((((.((.(.((((((..((((..(((.((....)).))).))))....)).))))).)).))))))))))..)))))))).(((....)))..((.((((((((((.((((.(......).)))).)))))))))).)).(((((((.((((((((.((((((.(((((((..(((((...(((((((.(((((..(((((((.((((...))))))).))))...))))).)).))))))))))..)))).)))....(((((((.................((((((((((((((((((((..........)))))))....((((((...(((((.((((.(.((((((.(((((...........((((((((.....(((((....))))).(((((...(.(((.(((....((...))....))).))).)))))).....)))))))))))))..)))))).......(((((((....)))))))...((((......))))........(((((((.(((...((((......(((((.....((((((.((((((....((((((.(((.....)))))))))(((((((.....)))))))..)))))).))))))...)))))...))))....)))))).))))).)))).)))))))))))..............((.(((.(((((..((...((((..............))))))))))).)))))....................((((((((((((((((((....((((.((.(((((..........)))((((((...(((((((((..(((.((...))))).))).))))))..))).))).........)))).))))......))))))...))))))..))))))(((((....)))))..)))).))).)))))).))))))).))))))(((((.((.((..((((...(((.....))).))))..))..)).))))).((((.(((((((..((((....)))).....((((..((((((((..((((........)))).((((.((((((..........((((.......)))).........)))))).)))).....((((....))))...(((((((....................))))))).......................(((((.......))))).((((((..(((..........)))....))))))..)))))..)))..))))..))))))).))))))))))))......(((..(((((.((.(((((((((....))))))))).))))))))))....(((((.(........).))))).(((((.........))))).....................)))))))...(((((.((..........)).)))))(.((((((...........)))))).).)).)))))))))........((((..(((.((((((...((((((((((...........))))).........))))).)))))).)))...)))).....((((((((.....))))))))...(((((((((((((((((((((((((((((........))))))..........))))))))).))))))))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((((({(.(((((((((.(((((.((((((.....,})))).....)))))...)))))))))(({{{{{|,((((({|....(((((((.{.({({((({((((((((.,,,(((((({{{{|,||,|{{.{{..(((((.,,.(((((..,}}|))))))}...|||||,||.||||,.,,,..,)))).})))}}|}||||||||}||}|{|,||,..,)),))}}}}|{||||{,,.}|||||{((((...(((....))),))))...,)))))).},))))))).}}.}))))),)).|||{.|{{{,,|||}|,||{|||||||||}..||||||||.(((....))),.||.((((((((((.((((.(......).)))).)))))))))),||{(({((((((({,.,{{{{,|||}}},|||{(..,,,||,}}|||||||}|||||.}|||||{..{|{|}},}||}|||.,,})...)))))})),)},,,,,,||{{||||||{|....|((|(({,....{{.,..{{,{.,(,((((((,(((,((((((({{{{......,))))),....((((((...(((((.((((.{.((((((.(((((,..........{(((((((.,,..{,,,{.,,})),,..(((((...(.(((.(((....({...},....))).))).)))))).....,))))))))))))..)))))).......(((((((....)))))))...((((,.....}}}|,.....|,|{{{({{.{{{,|.{{((,{{...(((({,....((((((.((((((.||,{(({{(,({{.....}}|||}}}}(((((((.....))))))),.)))))).))))))...}))))||.}}}}.,..}}}))).}))}||)))).))))))))))),{{.........}}}}}||,}}|.}}}}))...|)))}...,,..},,,.,}....,,,)),})))}},}}))}..,,,,,}.}}}}}{(((((((((((((((((,{{.((((.((.,((((..........)))|{{(((...(((((((((..(({,((...))))).))).))))))..))).}}|{....,,,,,,)).)))).,.,,.))))))...))))))..)))))}(((((....))))).,,,||,}....,|||,..,||}},...,.||{(({(.({.,{..{{{{..,{{{,...,},|,}}}}..)),.)).)))))}|{{{.|{{|{({..{{{,....,}||.{{{{(.{,...}.|||||,,|{{{....,.,,}},,.|{||.{|{{{{|{,.......{,,,......,||||{|......,)))))).))))..,,,,,,({{{{{{||..,,{{{(((,,,,,,.....{{{.{{,,{|||||,|,,,....................{{(((.......)))}}.((((((..((({,.....}}.}))....))))))..,.,,,..}}}.....,..}}}))}}.}}}|,..,,,........{{({{{,,.({(({{{((((((({...))))))))|,..{((((((.(((((({{{.{.......,|,||||}.(((((.........))))}...........}}}}......}},.}),,..}})))))))))))......,}))))),}|||||,..,..,,},.,)))))))),,)})}}}))))).,,.....{|{{,,|||,|||{((...{{((((((((.,........,)))))},,......})}}}.}})))).)))...)))).....((((((((.....))))))))...{((((((((((((((((((((((((((((........)))))),........,))))))))))))))))))))))})).....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001083588.2 NCBI
CUUCUCCUCGUUUCCACCCCUCCCCCCUCGGUCGUGGGCCUCAUUCACG… 1961 nt 0.4691
NM_001083589.2 NCBI
AGUCUACGUCCUUACAGGUGAAGCAAGCCUCUUAUAGGCAGCAUAAGUU… 1595 nt 0.3687
NM_001951.4 NCBI
CUUCUCCUCGUUUCCACCCCUCCCCCCUCGGUCGUGGGCCUCAUUCACG… 1964 nt 0.4695
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the E2F family of transcription factors. The E2F family plays a crucial role in the control of cell cycle and action of tumor suppressor proteins and is also a target of the transforming proteins of small DNA tumor viruses. The E2F proteins contain several evolutionarily conserved domains that are present in most members of the family. These domains include a DNA binding domain, a dimerization domain which determines interaction with the differentiation regulated transcription factor proteins (DP), a transactivation domain enriched in acidic amino acids, and a tumor suppressor protein association domain which is embedded within the transactivation domain. This protein is differentially phosphorylated and is expressed in a wide variety of human tissues. It has higher identity to E2F4 than to other family members. Both this protein and E2F4 interact with tumor suppressor proteins p130 and p107, but not with pRB. Alternative splicing results in multiple variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human patients identified the E2F5 as one of ten hub genes for predicting heart failure progression after myocardial infarction using machine learning algorithms [Xu et al. DOI:10.3389/fgene.2025.1592985].