Basic Information

Symbol
EBF2
RNA class
mRNA
Alias
EBF Transcription Factor 2 COE2 Collier, Olf And EBF Transcription Factor 2 Transcription Factor COE2 Early B Cell Factor 2 FLJ11500 EBF-2 Metencephalon-Mesencephalnon-Olfactory Transcription Factor 1 Collier, Olf And EBF 2 Early B-Cell Factor 2 OLF-1/EBF-LIKE 3 O/E-3 OE-3
Location (GRCh38)
8:25841725-26045413
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022659.4
Sequence length
5166.0 nt
GC content
0.4371

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1440.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1544.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1701.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022659.4 NCBI
AGGGCCGUAGUAACCCAUUCAUGGGGCCCGCGCGCGGCUGCAGCCGGGC… 5166 nt 0.4371
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the COE (Collier/Olf/EBF) family of non-basic, helix-loop-helix transcription factors that have a well conserved DNA binding domain. The COE family proteins play an important role in variety of developmental processes. Studies in mouse suggest that this gene may be involved in the differentiation of osteoblasts. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the EBF2 is a marker for electrophysiologically associated cardiomyocytes, as it is highly expressed in the ventricular cardiomyocyte cluster vCM5 following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].