Basic Information

Symbol
EBF4
RNA class
mRNA
Alias
EBF Family Member 4 O/E-4 COE4 KIAA1442 Transcription Factor COE4 Early B Cell Factor 4 Olf-1/EBF-Like 4 RP5-860F19.3 OE-4 Early B-Cell Factor 4 EBF-4
Location (GRCh38)
20:2692780-2760108
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001395167.1
Sequence length
3521.0 nt
GC content
0.6913

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1748.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1806.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1010.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001110514.2 NCBI
CCCUUCGGCUACCGCUCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG… 3009 nt 0.6713
NM_001395167.1 NCBI
CCCUUCGGCUACCGCUCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG… 3521 nt 0.6913
NM_001395168.1 NCBI
CCCUUCGGCUACCGCUCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG… 3290 nt 0.6991
Summary

EBF4 belongs to the conserved Olf/EBF family of helix-loop-helix transcription factors, members of which play important roles in neural development and B-cell maturation (Wang et al., 2002 [PubMed 12139918]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the EBF4 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption through transcriptional network analysis of postmortem prefrontal cortex [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].