Basic Information

Symbol
ECHDC3
RNA class
mRNA
Alias
Enoyl-CoA Hydratase Domain Containing 3 Enoyl-CoA Hydratase Domain-Containing Protein 3, Mitochondrial Enoyl Coenzyme A Hydratase Domain Containing 3 FLJ20909 Testis Tissue Sperm-Binding Protein Li 76m
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_024693.5
Sequence length
1633.0 nt
GC content
0.5928

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-687.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -716.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((((((((.(((((((((((....)))....))))))))......(((((((((((((((.((((((....)))))).))).....((((((....(((.(((((...))))).)))..))))))(((.((((....(((..((((((((..((((....))))..))))))))...)))..))))..)))(((((((.(((((((((((((....((((.(..((((((((((((((...)))))).....))))))))..))))))))))).......(((((...))))).)))))))))))))))))..)))))))))))))))(((((........))))).(((.((((((....((.(((((........))))).)).....(((((((.....)))))))......(((((((...((.(.((((((((((.(((((((.(((((((((((((((..((.((((((.(((((((((((..((((((((((((((...........(((((((........))).(((((((((......((((((.((...((((((((......))))).)))...)).)).(((((......))))).(((.(((((((((.(((((.....((.(((((.(((((.......))))).))).)).))..))))))))))))))..))).....(((((((((((((((.((((((((((...........))))).))))).)))))......)))))))).)).((.(((((.((((((...((((((((((.........))))..))))))(((((((.(((.((((....(((((.(((((((...(((((.((...(((((..(((((((......)).))))).))))).))...)))))...))))))).))))))))).))))))))))...)))))))))))...))(((((((((((...)))))).)))))..((.(((..((((((.(((((.(((.....))))))))....)))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))).(((.....)))(((((......))))).((((.((((((((.(((.(((((..((((...)))).)).)))))).....))))).)))...))))))).))))))))))).....)))))).))...))))))).)).)))...))).))))..)))...((((...........)))).....)))))))))).)..))...)))))))((((((((((....)))))))).))(((((((((...(((.......(((..((((((...(..((((.((((((((((.(.(((((((..........))))).)).))))))).)).))...))))..)...)))))).))).......))).)))))))))...)))))))))....))))....(((........))))))))...(((((...((......))...)))))..(((((.((((......)))).)))))......((((((((((.(((((((.(((...)))..))...((((......)))).......))))).))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,,..(({({(((((,,(((((((((({,.,,|,{..||,,|||||.,,,.{((((,,{((,|{(({.((((((....)))))),||||,|}.|{{|||||{{|||||{|||...}))}),||||.|||||,||||||{,.,.{(((({((((((((..((({....})))..))))))))...,{,..,|,.,|}}||||||{{|||||,,|||||||},,,||||,..,(((((((({({(((...}}}}}),,.,.)))))))),|||||||||}||....||.|{{|||,.,,)))}}))))))))})))||,},}}}},||||||||}}.{{{||.|,,,}}.}}}||,(({.((((((..,.{(.(((((........}}}}}.}},,...(((((((.....)))))))......(((((((...((.(.((((((((((.(((((((.((({(((((((((((..{{.((((((.(((((((((((..((({{((((((((({,....{{,...,},|||....,,{{||,,(((((((((,..,,.{((({,.((,,.{(((((((......))))).))),},,,.,,.(((((......))))).(((.(((((((((.(((((,|...||{((((({({((({{.....}})))})}),))}))}.))))))))))))))..)))..,,.(((((((((((((((.((((((((({..{{......,))))).))))).))))}.....,)))))))).)),{{.((({{{((((((...{(((((((((.........))))..)))))|(((((((.(((.(,((....(((((.(((((((...(((((.((...(((((..(((((((......)).))))).))))).}}...)))))...))))))).))))))))).)))))))))),..)))))))))))...)){((((((((((...)))))).))))}..{{.(((..((((((,(((((.(((.....)))))))).,,.)))).)),.)))}))}})))))))))))}))))}}}})))},..{{,.,,,))|(((((......)))))}{{((,(({{((((,(((.(((((..((((...)))).)).)))))).,.,.)))))}}))...)))}))).))))))))))).....)))))).}}...))))))).)).)))...))).))))}.}))...((((.,.........)))).....)))))))))).}..))...))))))),,((((((((....)))))))).},(((((((((...(((.......(((..((((((.,.(..((((.(({{((((((.(.(((((((..........))))).)).})))))).}}.))...))))..)..,)))))).))).......))).)))))))))...))))))}}}...})))),.|||{{.|....,,}}}})))),.,||||{,,,||......}}...||||}..{((({.{(({......}))}.})))),.,}.,((((((((((.((((({{.(((...)))..|||..{(((......)))},,.....})))).)))))))))),.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUAGUACGGACUGGGCCUGGCCUGGGGCGUCCCCGCGAAGCCUGGGCCU… 1633 nt 0.5928
Summary

Predicted to enable enoyl-CoA hydratase activity. Involved in positive regulation of cellular response to insulin stimulus. Located in mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ECHDC3 mRNA showed suggestively higher expression in platelets from patients with ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) compared to those with non-STEMI (NSTEMI), validating prior findings from whole blood studies [Eicher et al. DOI:10.3109/09537104.2015.1083543]. A study in humans identified the ECHDC3 as a potential myocardial infarction biomarker mentioned in the introductory discussion [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580].