Basic Information

Symbol
ECI2
RNA class
mRNA
Alias
Enoyl-CoA Delta Isomerase 2 HCA88 DRS1 PECI Hepatocellular Carcinoma-Associated Antigen 88 ACBD2 Diazepam-Binding Inhibitor-Related Protein 1 Acyl-Coenzyme A Binding Domain Containing 2 Peroxisomal 3,2-Trans-Enoyl-CoA Isomerase Peroxisomal D3,D2-Enoyl-CoA Isomerase Delta(3),Delta(2)-Enoyl-CoA Isomerase Renal Carcinoma Antigen NY-REN-1 D3,D2-Enoyl-CoA Isomerase Dodecenoyl-CoA Isomerase DBI-Related Protein 1 DRS-1 Enoyl-CoA Delta Isomerase 2, Mitochondrial Testicular Secretory Protein Li 33 DJ1013A10.3 EC 5.3.3.8
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_206836.3
Sequence length
1368.0 nt
GC content
0.4452

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-404.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -429.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 300.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((..((.(((((((((.((((((((((((((((((((.....)))).)).)).)))))......((((.((((((.(((..((((((((.............))))..)))).)))((((.....))))((((....))))....(((((.......)))))...........))))))..))))))))))).....)))))(((.....)))(((((......)).)))......(((((((..((((((.(((((((((.((((((.((((((((((.((((((((((..((((..(((((((.(.(....).).)))))))))))...)))))).........)))).))))).).))))..)))).....)).)))))))))..))))))......(((........)))((((.(((..(((.((((((.((((....)).))))))))..))).....)))))))(((..............)))........((((.(((((((((....)))).))))))))).((((((((.....(((.(((((((((((((((((((.....))))))))))((((..((.(((.(((((((.(((((......)))..))))))))).))).))..))))(((((((..(((((((((..(((.....................))))))))).))).))))))).......)))))).))).)))..)))..))))).)))))))...)))).)).)))))))))...........((((((.(((((((..(((..((.................))..))).(((((...(((.(((((((.(((((((....(((((((..............(((((..((...(((....((((.(((((((((((..((((.(((.((((((((((.((.(....).)).)))).......))))))))).)))).))))))))))).)))))))..)).)))))((((((((((............))))))))))((..(((((....)))))..)).))))))))))).)))...(((........)))..(((........)))..)))))))..)))...))))).))))))).))))))....(((((((((......((((((((..........))).))))).)))))))))((((((((((((((((......))))))))).))).))))...(((((....)))))........((........))....(((((((...((((((((..........))))))))))))))))))))............((((....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((({..((,((((({{(({{((((({(((({{{((((((,...,))))})}{||||,},,{{...(((((.((((((.(((..((({((((..,.......,..))))..}))}.)))((((.....)))){(({....}))}....(((((.......)))))....,,..,,.))))))..))))),)),..,,}}},,}}}(((.....}}){{{(({.{{{{||{|||{,.,,,,{(((({..{({{{(.{{{((({((,{,,,,,,}||{{|||||,|,.(((((((..((((..(((((((.(.(,...)},.)))))))))))...))))))).,}}}}},}}}}.}}}})})}))))}}.)))....}))})))))))))..}||||}......||||...,,..,|{((((((((..(((.((((((.(({{....)}.))))))))..))).....))))),,|||}}}.........,,|||........((((.(((((((((....)))).))))))))).((((({{(.,,..(((.(((((((((((((((((((.....))))))))))((((..((.(((.(((((({,(((((......)))..))))))))).))).)).,))))(((((({.,({{,{{{,,..{{{.,|,|.{..{,{|{{||,||||}},,,))),))),))))))).......)))))).))).)))..))},.))))),})}))}}|.})))).||.})))))))).....,,,,,,((((({.(((((((.,(({..,,.................|,..})).(((((...(((.(((((((,{({(((({...(((((((..............(((((..((...(((,...{(({.(((((((((((..((((.(((.(((((({{{{.((,{.,..,.}},)),},,.....))))))))).)))).))))))))))).}))))))..)).))))){(((((((((............)))))))))|((..(((((....)))))..)),))))))),)))})))...{{(........))}..{((........)))..)))))))..)))...))))).))))))).})))))...,(((((((((......((((((((..........))).))))).)))))))))|((((({(((((((((......))))))))).}))}}))),..{((({....))))}........{{.....,,.))....(((((((...((((((((.({,...,)})))))))))))))))))))).....,......,,||,,,...,,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGAUACCGCUGUCCAGGCGAAGGUCGCCGCCGUUGGAAGACCCUCCUUC… 1392 nt 0.4432
AGAGCCGCCCAAGGGAUGGCGAUGGCGUACUUGGCUUGGAGACUGGCGC… 1358 nt 0.4448
AGAGCCGCCCAAGGGAUGGCGAUGGCGUACUUGGCUUGGAGACUGGCGC… 1368 nt 0.4452
Summary

This gene encodes a member of the hydratase/isomerase superfamily. The protein encoded is a key mitochondrial enzyme involved in beta-oxidation of unsaturated fatty acids. It catalyzes the transformation of 3-cis and 3-trans-enoyl-CoA esters arising during the stepwise degradation of cis-, mono-, and polyunsaturated fatty acids to the 2-trans-enoyl-CoA intermediates. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A bioinformatics study in rats identified the ECI2 as a hub fatty acid metabolism-related gene that is upregulated in erectile dysfunction samples and demonstrated high predictive efficacy for disease occurrence with an area under the curve value close to 1 [He et al. DOI:10.1093/sexmed/qfae011].