Basic Information

Symbol
EDA
RNA class
mRNA
Alias
Ectodysplasin A ED1-A1 ED1-A2 EDA-A1 EDA-A2 XLHED EDA1 XHED EDA2 HED ED1 Ectodysplasin-A Oligodontia 1 ODT1 X-Linked Anhidroitic Ectodermal Dysplasia Protein Ectodermal Dysplasia 1, Anhidrotic Tumor Necrosis Factor Ligand 7C Ectodermal Dysplasia Protein EDA Protein STHAGX1 TNLG7C ECTD1 HED1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification

MANE select

Transcript ID
NM_001399.5
Sequence length
5235.0 nt
GC content
0.5247

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1985.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2065.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1024.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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CCCUUUCCCACCCCUCGGAGUAGAGCUGCACAUGCGGCUGCUCCCUGCU… 5235 nt 0.5247
Summary

The protein encoded by this gene is a type II membrane protein that can be cleaved by furin to produce a secreted form. The encoded protein, which belongs to the tumor necrosis factor family, acts as a homotrimer and may be involved in cell-cell signaling during the development of ectodermal organs. Defects in this gene are a cause of ectodermal dysplasia, anhidrotic, which is also known as X-linked hypohidrotic ectodermal dysplasia. Several transcript variants encoding many different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the EDA is a marker for microglia/macrophages, with its expression used to identify these cells co-expressing VEGF in the perilesional area of a brain contusion, showing a delayed maximum level [Sköld et al. DOI:10.089/neu.2005.22.353]. In a spinal cord contusion model, upregulation of Flt-1 and Flk-1 mRNA was induced in ED1-positive microglia/macrophages infiltrating the lesion by day 3 post-injury [Choi et al. DOI:10.1369/jhc.6A7139.2007].