Basic Information

Symbol
EDAR
RNA class
mRNA
Alias
Ectodysplasin A Receptor Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Member EDAR EDA1R EDA3 ED1R ED5 DL Ectodysplasin 1, Anhidrotic Receptor Anhidrotic Ectodysplasin Receptor 1 Ectodermal Dysplasia Receptor Ectodysplasin A1 Receptor Downless Homolog EDA-A1 Receptor ED3 Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia Downless, Mouse, Homolog Of Ectodysplasin-A Receptor ECTD10A ECTD10B EDA-A1R HRM1
Location (GRCh38)
2:108894471-108989372
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022336.4
Sequence length
4062.0 nt
GC content
0.4892

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1336.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1410.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 759.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022336.4 NCBI
AAACUUGCAGACAGGGCAGGGAGCGGUCAAGGAAGAGUUCCCGGGAAGC… 4062 nt 0.4892
Summary

This gene encodes a member of the tumor necrosis factor receptor family. The encoded transmembrane protein is a receptor for the soluble ligand ectodysplasin A, and can activate the nuclear factor-kappaB, JNK, and caspase-independent cell death pathways. It is required for the development of hair, teeth, and other ectodermal derivatives. Mutations in this gene result in autosomal dominant and recessive forms of hypohidrotic ectodermal dysplasia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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