Basic Information

Symbol
EDEM2
RNA class
mRNA
Alias
ER Degradation Enhancing Alpha-Mannosidase Like Protein 2 BA4204.1 C20orf31 C20orf49 ER Degradation-Enhancing Alpha-Mannosidase-Like Protein 2 ER Degradation Enhancer, Mannosidase Alpha-Like 2 FLJ10783 ER Degradation-Enhancing-Mannosidase-Like Protein 2 ER Degradation-Enhancing Alpha-Mannosidase-Like 2 Chromosome 20 Open Reading Frame 31
Location (GRCh38)
20:35115360-35147358
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018217.3
Sequence length
1884.0 nt
GC content
0.5441

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-701.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -733.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145025.2 NCBI
GAACCCGCAGCAGCUCCCAGGAUGAACUGGUUGCAGUGGCUGCUGCUGC… 1773 nt 0.5403
NM_018217.3 NCBI
GAACCCGCAGCAGCUCCCAGGAUGAACUGGUUGCAGUGGCUGCUGCUGC… 1884 nt 0.5441
Summary

In the endoplasmic reticulum (ER), misfolded proteins are retrotranslocated to the cytosol and degraded by the proteasome in a process known as ER-associated degradation (ERAD). EDEM2 belongs to a family of proteins involved in ERAD of glycoproteins (Mast et al., 2005 [PubMed 15537790]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

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