Basic Information

Symbol
EDEM3
RNA class
mRNA
Alias
ER Degradation Enhancing Alpha-Mannosidase Like Protein 3 C1orf22 ER Degradation-Enhancing Alpha-Mannosidase-Like Protein 3 ER Degradation Enhancer, Mannosidase Alpha-Like 3 Alpha-1,2-Mannosidase EDEM3 ER Degradation-Enhancing -Mannosidase-Like Protein 3 ER Degradation-Enhancing Alpha-Mannosidase-Like 3 Chromosome 1 Open Reading Frame 22 EC 3.2.1.113 CDG2V
Location (GRCh38)
1:184690237-184754907
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025191.4
Sequence length
6837.0 nt
GC content
0.3844

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1822.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1958.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2149.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001319960.2 NCBI
GCUCCGGGAUACUGAGGGCGGAGGGCGGUGGCAGCGCUGGCGCUGGGGA… 6885 nt 0.3834
NM_025191.4 NCBI
GCUCCGGGAUACUGAGGGCGGAGGGCGGUGGCAGCGCUGGCGCUGGGGA… 6837 nt 0.3844
Summary

Quality control in the endoplasmic reticulum (ER) ensures that only properly folded proteins are retained in the cell through recognition and degradation of misfolded or unassembled proteins. EDEM3 belongs to a group of proteins that accelerate degradation of misfolded glycoproteins in the ER (Hirao et al., 2006 [PubMed 16431915]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the EDEM3 mRNA expression level was significantly higher in the cecal ligation and puncture (CLP) group compared to the Sham group [Yang et al. DOI:10.1038/s41598-025-06463-2].