Basic Information

Symbol
EGR3
RNA class
mRNA
Alias
Early Growth Response 3 PILOT Zinc Finger Protein Pilot Early Growth Response Protein 3 EGR-3
Location (GRCh38)
8:22687659-22693480
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004430.3
Sequence length
4514.0 nt
GC content
0.5295

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1633.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1717.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1261.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199880.2 NCBI
ACUCCCUCAGCCUCCCACCCGGGAUGGAGCCAUGUGCGGCGUGGAGUCC… 3887 nt 0.5045
NM_004430.3 NCBI
GGGAGCUUUUGGGCAGCAGUGAGCUUGCUAGGAAGCGGCGGGGCUGGUG… 4514 nt 0.5295
Summary

This gene encodes a transcriptional regulator that belongs to the EGR family of C2H2-type zinc-finger proteins. It is an immediate-early growth response gene which is induced by mitogenic stimulation. The protein encoded by this gene participates in the transcriptional regulation of genes in controling biological rhythm. It may also play a role in a wide variety of processes including muscle development, lymphocyte development, endothelial cell growth and migration, and neuronal development. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood and established a robust age prediction model using 34 mRNA markers, including the EGR3 which exhibited a consistent trend in expression from young adulthood to later life [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].