Basic Information

Symbol
EGR4
RNA class
mRNA
Alias
Early Growth Response 4 NGFI-C PAT133 Early Growth Response Protein 4 AT133 NGFIC EGR-4
Location (GRCh38)
2:73290927-73293721
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001965.4
Sequence length
2220.0 nt
GC content
0.6595

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-995.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1033.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 598.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001965.4 NCBI
GAGCCCGGCAGCGCUUUGGAGAGGCGAGGAGCCGCCGCCCGAGGCCGGU… 2220 nt 0.6595
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in chromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue demonstrated that the EGR4 was downregulated in the dorsolateral prefrontal cortex of subjects with opioid use disorder compared to non-psychiatric controls, as identified through next-generation RNA sequencing [Mendez et al. DOI:10.1038/s41380-021-01259-y]. This finding was part of a broader dysregulation of immediate early genes converging on pro-angiogenic gene networks, with cell-type specific enrichment analyses revealing these effects in astrocytes, endothelial cells, and microglia.