Basic Information

Symbol
EIF2AK3
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Initiation Factor 2 Alpha Kinase 3 PERK PEK PRKR-Like Endoplasmic Reticulum Kinase Eukaryotic Translation Initiation Factor 2-Alpha Kinase 3 Protein Tyrosine Kinase EIF2AK3 Pancreatic EIF-2alpha Kinase Pancreatic EIF2-Alpha Kinase PKR-Like ER Kinase EC 2.7.11.1 EC 2.7.10.2 HsPEK WRS
Location (GRCh38)
2:88556741-88691518
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004836.7
Sequence length
4536.0 nt
GC content
0.4407

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1383.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1468.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1471.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001313915.2 NCBI
AGUUCAGAUGAGAGGUUUAGUGUAAAGUGGUAUAGGACAGAGGGGACAG… 4222 nt 0.4048
NM_004836.7 NCBI
AGGCUGUCACUCAGGUGGCAGCGGCAGAGGCCGGGCUGAGACGUGGCCA… 4536 nt 0.4407
Summary

The protein encoded by this gene phosphorylates the alpha subunit of eukaryotic translation-initiation factor 2, leading to its inactivation, and thus to a rapid reduction of translational initiation and repression of global protein synthesis. This protein is thought to modulate mitochondrial function. It is a type I membrane protein located in the endoplasmic reticulum (ER), where it is induced by ER stress caused by malfolded proteins. Mutations in this gene are associated with Wolcott-Rallison syndrome. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the EIF2AK3 gene exhibited differential expression in spleen leukocytes two hours after injury, showing upregulation in a burn model but downregulation in both lipopolysaccharide infusion and trauma/hemorrhage models [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005].