Basic Information

Symbol
EIF3J
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subunit J EIF3-Alpha EIF3-P35 EIF3S1 Eukaryotic Translation Initiation Factor 3, Subunit 1 (Alpha, 35kD) Eukaryotic Translation Initiation Factor 3, Subunit 1 Alpha, 35kDa Eukaryotic Translation Initiation Factor 3, Subunit J Eukaryotic Translation Initiation Factor 3 Subunit 1 EIF-3-Alpha EIF3 P35 EIF3j
Location (GRCh38)
15:44537098-44563029
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003758.4
Sequence length
2479.0 nt
GC content
0.3768

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-607.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -657.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 651.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001284335.2 NCBI
AACUCCUCGCUAGCUCUCCCUCUCACACACGCUCACACCCGGCUCGAGA… 2317 nt 0.3815
NM_001284336.2 NCBI
AACUCCUCGCUAGCUCUCCCUCUCACACACGCUCACACCCGGCUCGAGA… 2332 nt 0.3795
NM_003758.4 NCBI
AACUCCUCGCUAGCUCUCCCUCUCACACACGCUCACACCCGGCUCGAGA… 2479 nt 0.3768
Summary

This gene encodes a core subunit of the eukaryotic initiation factor 3 complex, which participates in the initiation of translation by aiding in the recruitment of protein and mRNA components to the 40S ribosome. There are pseudogenes for this gene on chromosomes 1, 3, and 9. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Sep 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.