Basic Information

Symbol
EIF4G3
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 Gamma 3 EIF4GII EIF-4-Gamma II EIF-4-Gamma 3 EIF-4G 3 EIF4G 3 Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 Gamma, 3
Location (GRCh38)
1:20806292-21177285
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001391906.1
Sequence length
6397.0 nt
GC content
0.4629

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1863.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1981.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1593.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198801.2 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6524 nt 0.4624
NM_001198802.2 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6434 nt 0.4613
NM_001198803.2 NCBI
GGAAUAUUUUUUCACCUUUGGCUUUUAGCUUAGAAGUUAUGACUGCACA… 2104 nt 0.4753
NM_001391892.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6229 nt 0.4614
NM_001391893.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 5969 nt 0.4505
NM_001391894.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6106 nt 0.4510
NM_001391895.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 2278 nt 0.5206
NM_001391896.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6079 nt 0.4616
NM_001391897.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6352 nt 0.4613
NM_001391898.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6115 nt 0.4626
Showing 1 to 10 of 20 entries
Summary

The protein encoded by this gene is thought to be part of the eIF4F protein complex, which is involved in mRNA cap recognition and transport of mRNAs to the ribosome. Interestingly, a microRNA (miR-520c-3p) has been found that negatively regulates synthesis of the encoded protein, and this leads to a global decrease in protein translation and cell proliferation. Therefore, this protein is a key component of the anti-tumor activity of miR-520c-3p. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

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