Basic Information

Symbol
EIF4G3
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 Gamma 3 EIF4GII EIF-4-Gamma II EIF-4-Gamma 3 EIF-4G 3 EIF4G 3 Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 Gamma, 3
Location (GRCh38)
1:20806292-21177285
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001391906.1
Sequence length
6397.0 nt
GC content
0.4629

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1863.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1981.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1593.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001391899.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 5966 nt 0.4504
NM_001391900.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6226 nt 0.4613
NM_001391901.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6250 nt 0.4616
NM_001391902.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6340 nt 0.4617
NM_001391903.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6156 nt 0.4518
NM_001391904.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6340 nt 0.4628
NM_001391905.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6250 nt 0.4525
NM_001391906.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6397 nt 0.4629
NM_001391907.1 NCBI
AGCCGUCCUGCCGGACUGCUGGAGGCGGCCACAGCGCCAUGUUGGAUGC… 6487 nt 0.4640
NM_003760.4 NCBI
CAAUCCCACAGAGUAUUGAUGAGGAAACUGAAGUUUGGAGCGAUCACAU… 6041 nt 0.4446
Showing 11 to 20 of 20 entries
Summary

The protein encoded by this gene is thought to be part of the eIF4F protein complex, which is involved in mRNA cap recognition and transport of mRNAs to the ribosome. Interestingly, a microRNA (miR-520c-3p) has been found that negatively regulates synthesis of the encoded protein, and this leads to a global decrease in protein translation and cell proliferation. Therefore, this protein is a key component of the anti-tumor activity of miR-520c-3p. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

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