Basic Information

Symbol
AGTR2
RNA class
mRNA
Alias
Angiotensin II Receptor Type 2 MRX88 AT2 Type-2 Angiotensin II Receptor Angiotensin II Type-2 Receptor AT2 Receptor Angiotensin Receptor 2 ATGR2
Location (GRCh38)
X:116170744-116174974
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000686.5
Sequence length
2862.0 nt
GC content
0.3651

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-718.79 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -771.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 736.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000686.5 NCBI
GCUAUUACGUCCCAGCGUCUGAGAGAACGAGUAAGCACAGAAUUCAAAG… 2862 nt 0.3651
NM_001385624.1 NCBI
GCUAUUACGUCCCAGCGUCUGAGAGAACGAGUAAGCACAGAAUUCAAAG… 2802 nt 0.3651
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the G-protein coupled receptor 1 family, and functions as a receptor for angiotensin II. It is an intergral membrane protein that is highly expressed in fetus and in neonates, but scantily in adult tissues, except brain, adrenal medulla, and atretic ovary. This receptor has been shown to mediate programmed cell death and this apoptotic function may play an important role in developmental biology and pathophysiology. Mutations in this gene are been associated with X-linked cognitive disability. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) and SARS-CoV-2 infection results in down-regulation of angiotensin converting enzyme-2 (ACE2) receptors, the effects of which, triggers serious inflammatory lesions in the tissues involved, primarily in the lungs. The inflammatory reaction appears to be mediated by angiotensin II derivatives, including the angiotensin AT2 receptor which has been found to be upregulated in bronchoalveolar lavage samples from Coronavirus disease 2019 (COVID19) patients. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that spinal nerve ligation induced a 25.34-fold upregulation of the AGTR2 in injured dorsal root ganglia, as identified through strand-specific RNA sequencing and validated by quantitative real-time PCR [Wu et al. DOI:10.1177/1744806916629048].