Basic Information

Symbol
ELF3
RNA class
mRNA
Alias
E74 Like ETS Transcription Factor 3 ESE-1 ERT EPR-1 ESX E74-Like Factor 3 (Ets Domain Transcription Factor, Epithelial-Specific ) Epithelium-Specific Ets Transcription Factor 1 ETS-Related Transcription Factor Elf-3 Epithelial-Restricted With Serine Box Epithelium-Restricted Ets Protein ESX E74-Like Factor 3 (ETS Domain Transcription Factor, Serine Box, Epithelial-Specific) Ets Domain Transcription Factor, Serine Box (Epithelial-Specific) E74-Like Factor 3 (Ets Domain Transcription Factor) E74-Like Factor 3 JEN
Location (GRCh38)
1:202007945-202017183
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004433.5
Sequence length
3104.0 nt
GC content
0.5264

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1132.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1184.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 619.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114309.2 NCBI
AGGCUCUAUUUAGAGCCGGGUAGGGGAGCGCAGCGGCCAGAUACCUCAG… 3218 nt 0.5277
NM_004433.5 NCBI
AGGCUCUAUUUAGAGCCGGGUAGGGGAGCGCAGCGGCCAGAUACCUCAG… 3104 nt 0.5264
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Involved in inflammatory response; negative regulation of DNA-templated transcription; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in Golgi apparatus; cytosol; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the ELF3 transcript, an ETS-related transcription factor, increased in abundance postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].