Basic Information

Symbol
ELF4
RNA class
mRNA
Alias
E74 Like ETS Transcription Factor 4 ELFR MEF E74-Like Factor 4 (Ets Domain Transcription Factor) ETS-Related Transcription Factor Elf-4 Myeloid Elf-1-Like Factor E74-Like Factor 4 AIFBL2
Location (GRCh38)
X:130063955-130110904
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001421.4
Sequence length
5140.0 nt
GC content
0.5426

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1875.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1966.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1421.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127197.2 NCBI
GCAUUUCCCCUUUCGCUCGCUCGUUUCGGUGCAUGUCUGCGCCGGUUCG… 4320 nt 0.5595
NM_001421.4 NCBI
ACUUCUCCUUUCGCCGGCGCCGAGUUCCUGGCGCCGCUCGCCCGGCCCG… 5140 nt 0.5426
Summary

The protein encoded by this gene is a transcriptional activator that binds and activates the promoters of the CSF2, IL3, IL8, and PRF1 genes. The encoded protein is involved in natural killer cell development and function, innate immunity, and induction of cell cycle arrest in naive CD8+ cells. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the transcription factor ELF4 is activated in Kupffer cells following short-term alcohol exposure, with its activity significantly increased at the one-day time point (AG1) and implicated in immune function regulation [Cao et al. DOI:10.3390/Ijms24054344].