Basic Information

Symbol
ELL
RNA class
mRNA
Alias
Elongation Factor For RNA Polymerase II C19orf17 PPP1R68 ELL1 Men Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 68 Eleven-Nineteen Lysine-Rich Leukemia Protein RNA Polymerase II Elongation Factor ELL Elongation Factor RNA Polymerase II ELL Gene (11-19 Lysine-Rich Leukemia Gene) Eleven-Nineteen Lysine-Rich Leukemia Gene Chromosome 19 Open Reading Frame 17 ELL/KMT2A Fusion Protein KMT2A/ELL Fusion Protein
Location (GRCh38)
19:18442663-18522116
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006532.4
Sequence length
3970.0 nt
GC content
0.5947

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1653.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1724.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1093.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006532.4 NCBI
AGAGAUGGUCGCAAGAUGGCGGCGCUGAAGGAGGAUAGGAGCUACGGGC… 3970 nt 0.5947
Summary

Enables phosphatase binding activity. Involved in positive regulation of DNA-templated transcription and snRNA transcription. Located in cytosol; euchromatin; and nuclear body. Part of transcription elongation factor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ELL transcript, an elongation factor for RNA polymerase II, exhibited increased abundance postmortem, with its profile categorized among cancer-related genes [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].