Basic Information

Symbol
ELL2
RNA class
mRNA
Alias
Elongation Factor For RNA Polymerase II 2 MRCCAT1 Metastatic Renal Cell Carcinoma-Associated Transcript 1 RNA Polymerase II Elongation Factor ELL2 Elongation Factor, RNA Polymerase II, 2 ELL-Related RNA Polymerase II, Elongation Factor Elongation Factor RNA For Polymerase II 2
Location (GRCh38)
5:95885098-95961871
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012081.6
Sequence length
5826.0 nt
GC content
0.3888

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1551.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1661.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1437.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012081.6 NCBI
AGUAUAUGACAGUACGUCAGCAGCGGGAUGGCCCUAGCAGUGGCGGCGG… 5826 nt 0.3888
Summary

Predicted to enable cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in snRNA transcription by RNA polymerase II. Located in nucleoplasm. Part of transcription elongation factor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that the ELL2 was significantly upregulated in left ventricular tissue from animals with spontaneously occurring hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls, identifying it as a differentially expressed gene associated with the disease [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].