Basic Information

Symbol
AGXT
RNA class
mRNA
Alias
Alanine--Glyoxylate Aminotransferase AGT1 AGT SPT Ser-PyrAT AGXT1 TLH6 SPAT PH1 Alanine--Glyoxylate And Serine--Pyruvate Aminotransferase L-Alanine: Glyoxylate Aminotransferase 1 Serine--Pyruvate Aminotransferase Hepatic Peroxisomal Alanine:Glyoxylate Aminotransferase Serine:Pyruvate Aminotransferase Primary Hyperoxaluria Type 1 Glycolicaciduria EC 2.6.1.44 EC 2.6.1.51 Oxalosis I
Location (GRCh38)
2:240868543-240881531
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Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000030.3
Sequence length
2900.0 nt
GC content
0.5669

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1142.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1190.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000030.3 NCBI
AGUGCAGCCCCAGGUUCCCGAGCGGCAGGUUGGGUGCGGACCAUGGCCU… 2900 nt 0.5669
Summary

This gene is expressed only in the liver and the encoded protein is localized mostly in the peroxisomes, where it is involved in glyoxylate detoxification. Mutations in this gene, some of which alter subcellular targetting, have been associated with type I primary hyperoxaluria. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acetylcorynoline pretreatment significantly reduced elevated serum levels of the AGXT in LPS/D-GalN-induced and alcohol-induced acute liver injury models, indicating its efficacy in alleviating liver damage [Fu et al. DOI:10.1016/J.Intimp.2024.113550].