Basic Information

Symbol
ELP2
RNA class
mRNA
Alias
Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 2 STATIP1 StIP Signal Transducer And Activator Of Transcription 3 Interacting Protein 1 Elongator Complex Protein 2 STAT3-Interacting Protein 1 FLJ10879 SHINC-2 Elongation Protein 2 Homolog (S. Cerevisiae) Elongation Protein 2 Homolog Elongator Protein 2 MRT58 StIP1
Location (GRCh38)
18:36129444-36180557
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018255.4
Sequence length
8432.0 nt
GC content
0.4307

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2772.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2924.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2220.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001242875.3 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8627 nt 0.4328
NM_001242876.3 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8417 nt 0.4334
NM_001242877.3 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8354 nt 0.4314
NM_001242878.3 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8222 nt 0.4313
NM_001242879.3 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8222 nt 0.4319
NM_001324465.2 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8300 nt 0.4306
NM_001324466.2 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8549 nt 0.4335
NM_001324467.2 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8282 nt 0.4308
NM_001324468.2 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8353 nt 0.4306
NM_018255.4 NCBI
GCGUCUCUUGUUUGUGCGGCUGACCAGUUGGCGACAUGGUGGCACCCGU… 8432 nt 0.4307
Summary

The protein encoded by this gene is a core subunit of the elongator complex, a histone acetyltransferase complex that associates with RNA polymerase II. In addition to histone acetylation, the encoded protein effects transcriptional elongation and may help remodel chromatin. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the ELP2 as a transcription factor with sustained increased expression post-burn, suggesting it may be a driver for inducing an immunosuppressive state during recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].