Basic Information

Symbol
ELP3
RNA class
mRNA
Alias
Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 3 KAT9 TRNA Uridine(34) Acetyltransferase Elongator Complex Protein 3 FLJ10422 Elongation Protein 3 Homolog (S. Cerevisiae) Protein Lysine Acetyltransferase ELP3 Elongation Protein 3 Homolog EC 2.3.1.311 EC 2.3.1.48 HELP3
Location (GRCh38)
8:28089673-28191156
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018091.6
Sequence length
3148.0 nt
GC content
0.4705

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-964.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1022.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001284220.2 NCBI
GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 3048 nt 0.4715
NM_001284222.2 NCBI
GAAGCUUCAGGAGACCUAUCCUCAUCUGUGCAAGGAGGAGUGGCCAACU… 3154 nt 0.4705
NM_001284224.2 NCBI
GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 2945 nt 0.4672
NM_001284225.2 NCBI
GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 2984 nt 0.4715
NM_001284226.2 NCBI
GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 3009 nt 0.4673
NM_018091.6 NCBI
GGCUGUCAGCUUUCCCCGUGGUCUGAGUUUGUGGCUGCAUUUUUAUCUC… 3148 nt 0.4705
Summary

Enables acetyltransferase activity and phosphorylase kinase regulator activity. Involved in regulation of transcription by RNA polymerase II and tRNA wobble uridine modification. Located in cytosol and nucleolus. Part of elongator holoenzyme complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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