Basic Information

Symbol
ENC1
RNA class
mRNA
Alias
Ectodermal-Neural Cortex 1 KLHL37 PIG10 ENC-1 TP53I10 NRPB Ectodermal-Neural Cortex 1 (With BTB-Like Domain) Ectodermal-Neural Cortex 1 (With BTB Domain) Ectoderm-Neural Cortex Protein 1 Nuclear Matrix Protein NRP/B Kelch-Like Family Member 37 P53-Induced Gene 10 Protein Kelch-Like Protein 37 Nuclear Restricted Protein, BTB Domain-Like (Brain) Tumor Protein P53 Inducible Protein 10 Kelch-Like 35 KLHL35 CCL28
Location (GRCh38)
5:74627406-74641424
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003633.4
Sequence length
4821.0 nt
GC content
0.4777

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1578.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1675.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1164.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256574.2 NCBI
GCAGACUGCUCUGGCAGCCGGAGAGGAGGCGGUGCGGCGGUGGCGCUGC… 4958 nt 0.4754
NM_001256575.2 NCBI
GCAGACUGCUCUGGCAGCCGGAGAGGAGGCGGUGCGGCGGUGGCGCUGC… 4946 nt 0.4755
NM_001256576.2 NCBI
GCAGACUGCUCUGGCAGCCGGAGAGGAGGCGGUGCGGCGGUGGCGCUGC… 4685 nt 0.4768
NM_003633.4 NCBI
GCAGACUGCUCUGGCAGCCGGAGAGGAGGCGGUGCGGCGGUGGCGCUGC… 4821 nt 0.4777
Summary

This gene encodes a member of the kelch-related family of actin-binding proteins. The encoded protein plays a role in the oxidative stress response as a regulator of the transcription factor Nrf2, and expression of this gene may play a role in malignant transformation. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 20 1 2]

Forensic Context

A study in humans identified the ENC1 as a differentially expressed gene among the top 10 by P-value when comparing the 7-day versus 3-month post-acute myocardial infarction time points [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3]. A study in rats demonstrated that hypothalamic mRNA expression of the ENC1 was differentially expressed between control and hypothermic conditions, with 14 tags in control hypothalami compared to 4 tags in hypothermic hypothalami, identifying it as an RNA marker for hypothermia diagnosis [Takamiya et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2012.04.017].