Basic Information

Symbol
ENTPD1
RNA class
mRNA
Alias
Ectonucleoside Triphosphate Diphosphohydrolase 1 ATPDase NTPDase-1 SPG64 CD39 Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolase 1 Lymphoid Cell Activation Antigen Ecto-ATP Diphosphohydrolase 1 ATP Diphosphohydrolase Ecto-ATPDase 1 Ecto-ATPase 1 CD39 Antigen Ecto-Apyrase EC 3.6.1.5 NTPDase1 ATP-DPH EC 3.6.1
Location (GRCh38)
10:95711779-95877266
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001776.6
Sequence length
12493.0 nt
GC content
0.4141

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3434.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3677.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3445.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

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NM_001164178.1 NCBI
CCUGUUGCUCUUUGCUCUAAUGAGCCUUGAGAAAGGAUUGCUGGUCAUG… 12515 nt 0.4138
NM_001164179.2 NCBI
ACGGAGACGGACCACAGCAAGCAGAGGCUGGGGGGGGGAAAGACGAGGA… 12370 nt 0.4138
NM_001164181.1 NCBI
CCUGUUGCUCUUUGCUCUAAUGAGCCUUGAGAAAGGAUUGCUGGUCAUG… 12387 nt 0.4135
NM_001164182.2 NCBI
ACGGAGACGGACCACAGCAAGCAGAGGCUGGGGGGGGGAAAGACGAGGA… 12342 nt 0.4132
NM_001164183.2 NCBI
ACGGAGACGGACCACAGCAAGCAGAGGCUGGGGGGGGGAAAGACGAGGA… 12224 nt 0.4129
NM_001312654.1 NCBI
CCUGUUGCUCUUUGCUCUAAUGAGCCUUGAGAAAGGAUUGCUGGUCAUG… 12561 nt 0.4129
NM_001320916.1 NCBI
CCUGUUGCUCUUUGCUCUAAUGAGCCUUGAGAAAGGAUUGCUGGUCAUG… 2171 nt 0.4251
NM_001776.6 NCBI
ACGGAGACGGACCACAGCAAGCAGAGGCUGGGGGGGGGAAAGACGAGGA… 12493 nt 0.4141
Summary

The protein encoded by this gene is a plasma membrane protein that hydrolyzes extracellular ATP and ADP to AMP. Inhibition of this protein's activity may confer anticancer benefits. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

A study in humans identified ENTPD1 as one of seven susceptibility genes where mutation increases the risk of sepsis in patients with severe burn injuries [Huang et al. DOI:10.1093/burnst/tkac050].