Basic Information

Symbol
EP300
RNA class
mRNA
Alias
EP300 Lysine Acetyltransferase P300 Histone Acetyltransferase P300 E1A Binding Protein P300 KAT3B Protein 2-Hydroxyisobutyryltransferase P300 Protein Propionyltransferase P300 Histone Crotonyltransferase P300 Histone Butyryltransferase P300 Protein Lactyltransferas P300 E1A-Associated Protein P300 EC 2.3.1.48 P300 HAT E1A-Binding Protein, 300kD EC 2.3.1.- EC 2.3.1 MKHK2 RSTS2
Location (GRCh38)
22:41091816-41180077
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001429.4
Sequence length
8779.0 nt
GC content
0.4979

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2731.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2893.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2071.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001362843.2 NCBI
GAGAAGGAGGAGGACAGCGCCGAGGAGGAAGAGGUUGAUGGCGGCGGCG… 8701 nt 0.4978
NM_001429.4 NCBI
GAGAAGGAGGAGGACAGCGCCGAGGAGGAAGAGGUUGAUGGCGGCGGCG… 8779 nt 0.4979
Summary

This gene encodes the adenovirus E1A-associated cellular p300 transcriptional co-activator protein. It functions as histone acetyltransferase that regulates transcription via chromatin remodeling and is important in the processes of cell proliferation and differentiation. It mediates cAMP-gene regulation by binding specifically to phosphorylated CREB protein. This gene has also been identified as a co-activator of HIF1A (hypoxia-inducible factor 1 alpha), and thus plays a role in the stimulation of hypoxia-induced genes such as VEGF. Defects in this gene are a cause of Rubinstein-Taybi syndrome and may also play a role in epithelial cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for EP300 Gene

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) significantly downregulated EP300 expression (0.57-fold) alongside 58 other genes, as identified by cDNA microarray analysis [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].