Basic Information

Symbol
EPB41L5
RNA class
mRNA
Alias
Erythrocyte Membrane Protein Band 4.1 Like 5 KIAA1548 LULU1 BE37 YMO1 LULU YRT Band 4.1-Like Protein 5 FLJ12957 Erythrocyte Membrane Protein Band 4.1-Like 5 Yurt Homolog (Drosophila) Yurt Homolog
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_020909.4
Sequence length
6556.0 nt
GC content
0.4320

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1948.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2073.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1817.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(((((((((.(((((.(((.(((((((((((.......)))))))).))).))))))))........((((......)))).......))))))))).))))(((((((..((((..((((((((.........))))))))(((.....)))((((((..((((((((((((((((....))))..((((((...((((((((.(.((.....))((.((.............)).))((((.........))))........).))))).)))))))))..)))).)))))))))))))))))).))).......))))..))))).((((((.((...((((....(((((..((((..((((.(((.......((((((((((((........((((((((((.(((........))))))))))(((.....(((((((....((((((((((.(((((...........((..((.((((((((....((((..(((....)))..))))....)))).)))).))..))))))).))))))))))...........(((...((((((((..(((...........))).((((((((((((.((....(((((((..............((((((((((((((((((.((.....)).)))))))((((((((......))))))))..(((((((..(((...((....))...)))..))).........(((((((((((....((((..........((((....))))..........)))).....((((....))))...........(((((((...((((((((((.((.((((((((..(((((..(((.((((((((((....((....))))))))(((((((....(((((.((((..((((.((((((((......)))))))))))).)))))))))...)))))))......(((((((.(((((.....))))).)))))))..........)))))))))))))))))))).)).))))))(((..(((((.....((....)).....))))).)))((((.(((((((((....((((...))))..........((((((((((((......)))...(((.((((..(((........))).)))).)))....((((((((........................((...)).....(((((....)))))..........)))))))).)).)))))))......)))))))))))))............((((.....))))......)))).))))))).........((((...((((((..((.((((...)))).))..)))))))))))))))))))))(((((((((.........)))).)))))...((((((..(((((.(((.......(((((....(((((.....))))).............)))))......))))))))..))))))..))))((((.(((((...((((........).))).....)))))))))((((((..(((((((.((((((((....))))....(((((((((((..((.((((((....((((........((....))........))))..)))))).))..(((......))).......)))))).))))).)))).)))))))...........(((((((((...((((.(((..(((.(....((((((((......)))))).)))))).....))).)))).....))))))))).((((((((......)))))))).............))))))...(((((((.......).))))))................))))).))))))...)))))))....)).)))))))))))))))))))).)))............(((((((....)))))))))))))).....))).(((......)))(((((((((((((((((..((((((....((((((.......))))))....(((((....((((((......))))))...)))))((.(((((.(((....(((((.((((((.(((((....)))))...((((((((.(((((..((((...(((((..((((((......((((((((((((.(((((((.........((((((..(((.((((.......(((((.((.....((((.(((((((((..(((((((.(((((((....(((((......)))))....(((...((((((....)).))))..))).)).))))).).)))))).))).))))))..))))......)).)))))......((((((........)))))).)))))))....))))))...(((((.(......).))))).........((((...(((((........(.(((((((..........((((.......))))...........))))))))......).))))....))))..((((((((((((.(((((..........((((((((.......))))))))........(((((((.....)))))))((((((.(((....))).....(((((...))))).........(((.((((((.((((.(((.(((...(((((((..((.......(((((((((((((.(((.(((...((..((((((.....))))))..)).))).))).))))))..)).))))).....))..)))))))......))).)))))))...)))))).))).))))))((((((((((.......................)))))))))).)))))))))))))))))....))))))))).))).((((((((((..(((((....((.(((((.........(((((........)))))..)))))))...)))))))))))))))......)))))))......)))))))))))...))))..)))........))))))))))..((((...)))).(((....)))))))))))))).))).))))).))(((((((......)))))))))))))..(((....)))....((((((..(((..(.((((((.((((((.....)).))))))))))).)))...))))))...)))))))..))))).))))).(((((((..(((((((..(((((............)))))....)))))))....)))))))..............))))))))))))))).)))))))..))))(((((((((((...)))))))...))))(((((((((.((((.((.((((((((...............)))...(((..((((((.((((((((....(((((((((((((........((((......)))).(((.....((((((((((.((((((...))))))....((((....(((((((((((((((((..(((...((((.............)))).)))..)))))...)))))))..)))))..))))....((....))(((((((((((.(((((.(((((((((((((...)))))).((((.((((....(((.(((......)))....)))....)))).))))..((((((......)))))).....((((((((((.((((......(((((((.((.....)).)))))))............((((((((..((...........))..))))))))..((((((((((.......((((....)))).(((((.((.((((......)))).)).))))).))))))))))(((((((((((((..(((((....)))))))))).))))))))...)))))))))............(((((((...........)))).)))(((((((((((..(((((......)))))...((((((((..(((((((.(((.(((((((((...(((((.......(((...(((((((........)))))))...))))))))))))))))).)))((((((((((((.......))))).........)))))))(((((.((((...(((....))))))).)))))(((((((......))))))).((((((...))))))((.(((......))).)).(((((..((.(((((.(((((.(((....(((((..((((((....))))))))))).....)))....)).))).)))))..))...)))))((((.(((((((........))))))).))))((((((((((.........(((((...)))))...(.((((((((((((((((((......)))))...)))))...(((..(((((....))))).)))......((((((((...........))))))))...)))))))).)....(((((((((((((...((((((((((((......)))))))..........((((((...............)))))).((((((((((((.(((........((.(((((.(((((((((((((.(((..((....(.(((((.((((((((((((..((((.((((.((((..((.(((((..(((((((((((((((..((.((.((((..(((((((.(((((.(((((((((((((.........)))))((((...((.((....(((((((.....(((((((..((.....)).)))))))(((((((((((......))).)))))))).)))))))...))))...))))...)))))))))))))))).))))...(((((((((((.(((((.(((((((((((......((((((.((((((((.((((..(.(((((.......)).))).)..)))........).)))))))).........))))))..))).))))))))))))).((((.((((..((((.....((((((((.((.(((((.((...)).))))).))))))))))..)))).)))).)))))))))))))))((((.........)))).(((((((...............)))))))...)))))).))..)))))))))))))))..))))).)).))))....((((((...........))))))..(((((.(((.....))))))))...))))))))..)))..........))))))))).))))).).....))..))).))))))))).)))).))..))).)).....((((((((.....))))))))....((.((....(((.(((((.(((.(((.(((((((((((.(((((((.....))))....))).)))))).))))).)))))).))))))))...)).))..(((.(((((....))))).)))((((((....))))))))))))))))))))).)))))...)))))))))))))...(((((....)))))...)))))))))).(((((((((.(((...........)))...)))))))))(((((......)))))))))))).))))))))(((((.(((.....))).)))))((((........)))).)))))))))))........)))))...))))))).))).).)..)))))))))))(((((..((((..((((.(((((((((.((.(((((.....(((((.(((((....))))).).))))))))).))((((....(((((.(((((....))))).).)))).....((((((....((((((..................))))))))))))))))(((((((.((.(((.((((((((((((((((...((((((((.((((......((((((.((((...............)))))))))).....))).).))))))))...)))))))(((((...))))).((((.(((((((.....))))))))))).........(((((((((...((((((((.((.....)).)).((((....))))..)))))).)))))))))..)))))).....(.((((...)))).)..))).))).)).))))))).)).))))))).)))).))))..)))))))))))))))......))))))))))))))))..)))))))))))))).)))(((((.((.((.((((((.......)))))).)).)).)))))...............))))).)).)))))))))).))).(((((((((((.(((((...)))))........((((((.(((((((((((......))))))....((........)))))))...)))))).))))))..)))))....)))))))))...)).)))))).(((((..(((...................))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((((((..(((((((({(((((,.,,(,((((({,.,{{{{{||,,,,,,))))}))),))))}.......|||},.}}.})))))})))))||{((((|,.}}||||{.{,({,{{||,,{(((((((,.......,)))))))|{{{.,,.,||}|,{|||,||{(((({(((,(((((....))))}.|||,{{,,||{||||{{,,.{{....,}}||.||,........,||,},.|}{|||,....,{{{||||.,,,.,.|||||||},||{|},,}}}})))}.}))))))},,))))||}|||}.......,}))}..|}|||,{{,{{({((||{{{({,...,{{(((.((((..(((||{{{...||..((((((((((((..,,{{||{{||||||{|,,,,,..,|.|{||}}||||}}({{.....{{(({{{....,(((((((({.(({((...........{,.,({,{{{,,{,({{..{{,,..,(((((({{{..........})).)))))))},,)}})))}.}}}}}}}}}|.,,,.,,....{{{,,.(({((((({,({{.........,.}}},((((((((((((.((....(((((((..............((((((((((((((((((.((.....)).)))))))((((((((......))))))))..,,{{{{(,.{(({..,|,,|,||{{||,,..{{||||||||..((((((((((((.,.(({(,,,.......((((....))))..........}}}}.....((((...{||||{...,(({(((,,,,,,.}}}||}|,|||||}.}}||,..,,{{{{,.,{,{{|||,{{((((,{,..,,((|.,,||,}}},{(((((((....(((((.((((..((((.((((((((......)))))))))))).)))))))))...)))))))}.....|||||||}|||||.,...,,{((({((|{|,.{(((,,((({........})))))))).,.)),))))))),,..{((({(,..,((({{....}}))))}}|,||.{(((.{((((((((....((({...))))...,......((((((({{{((..,,.,|}|,,.{((,{((({{(({.,{.....|||{|,,|{,,,...}|,,|||||........................,....,,.....(((((....))))).........,)}}))))),),.)))}))}......))))))))))))).,....,,}},.((((.....)))),,.....})).,,,,))),,|,}..||||||}}}((((((..((.((({...)))).))..)))))),..))))))))))))(((((((((.........)))).)))))...{(((((..((((,{(((.......(((((....(((((.....})))).,.......,...)))))....,.))))))))..)))))|,..{{{((({.{{{{|,}}||{{}}.,,,,.,.,,,.{{..,,,))))},((((((..(((((((.((((((((....))))....(((((((((({..{({({(((,....((((.........,....))}}....,})))}..||||}}.}|,.{{{...,,,}}}...)))))))))).))))).)))).))))))}...........(((((((((.{.((((.(((.,(((.(....((((((((......)))))).))})))...,.))).))))...,.))))))))).((((((((......))))))))||{,.....,..,))))))...,{|{,,,....,,,},)))))},,,,,))}........))))).))))))...)))))))....)).)))))))))))}}))))))}.|||,,,.........(((((((....)))))))}}}}}}}.....}}},{||},},}|}||{(((({({{{{((((({....((({...{((((((..{{{{{||.{{{,...{{||||.,,{{{{{{,,....)))))|,,{{||||{|,{{{{{.{{{.,,,|||{{.((((((,(((((....)))))...((((((((.(((((..((((...(((((..((((((......(((((((({{((.(((((((.......,,(((,(({,{{{,{{|,|||,,..{{(((,((,{...,|||,(((((({(({.(((((((.(((((({....(((((......)))}),.{,{((...(((({(....)),})))..)))}}).))))).).)))))).,)),)))))).,||||,|,...}}.|||||,.....|||||{......,,)))))).,},||||...,||},|{{{.(((((.(......).))))).}}}|...,|||,.,,{||||,.......{,({{{{{{...{{{{{,.,,,.,))),..}}}},,,,,,,..},})})))),.....|||}}}}}}}}})}}},((((((((((((.(((((..........{(((((((.......))))))}|,.......||{||||,,,,,}}}}}}}{((({{.{{{.,,.|||,,,..{((((...}}})}.........||{.((((((.((((.(((.{((...,{{{{{{,.{,.,||,..,(((({(((((((,({{.{||.,,||,,|||||(.....|||||},,||.}}}.}}),)))))),.,,||||||.....,,..))))))},,....))).)))))))...)))))).}}),)))))|((((((((((.......................))))))))))}})))))))))))))))),,,.))))))))).}}}.((((((((((..(((((..,.,{.((({....,{{,,.(((({......}.)))})..)))))))...)))))))))))))))......)))))))......)))))))))))...))))..))}.......,))))))))))..{,{,...,}}}.,,.....,,)))))))||}||,|||,|}}}}.}}|((((((......))))))},,{(((((((((.(((....))).))))..)))))}.{(((((.((((((.....))},)))))))))}})))}}}.}))}},}}))))))}..}}))).)))),.(((((((..(((((((..(((((..,......}..)))))....)))))))....))))))).................})))))))))))}))}))))..))))))}|,{||||||||||||||,.,||||.,,,((((((,((((.({.(((({({({,....,..{{,...|,|,,.(((..(((((,{((((((((....(((((((((((((........((((......)))).(((.....((((((((((.((((({...})))))....{{{(,...(((((((((((((((((..(((...((((.............)))).)))..)))))...)))))))..)))))..,)))....((....}}{(((((((((({{{(((.{((((((((((((...)))))).((((.((((....{((.(((......)))....)))....)))).))))..((((((......)))))).....((((({(({,.,{({,.....{((((((.{{....,}}.))))))},,..........{(((((((.,({{{{.........,..})))}})}..((((((((((.......((((....}))),(((((.((.((((......)))).)).))))).)))))))))),{{{{{{{|{{{{..{{{{{...,)))})))))).))))))),.....||||||,..||,,.....}||||{((,...,......))))}||}(((((((((((..(((((......)))))...((((((((..(((((((.{(,{((((((((({{{((((({{{{,.{((({..,,,{{{{.......,))}||||,,.|||,|}}}}}|}||}||,}||((((((((,{(({,,{,,.,,}},...,,},,))))))))||{{|,((({...,|}},,.)))))))}}}}},(((((((......))))))).((((({...})))))((.(((......))).)}.{{{{{,.,{|{{{((.{{,||.|||,..........,|||||.,}})))))))),))}){{.|((({{{{,{|||{||,,,,.})}}{||||,((((.(((((((........))))))).))))((({({{{({..{{{{{{.,,,||}}}))))),,,{.((((((({{{{{{{{{((......))))).,.)))},...(((..(((((....))))).)))....,.((((((((.........,.))))))))...}))))))).}....(((((((((((((...((((((((((((......))))))).......,,.((((((,..........,.,.)))))),|(((((((((({,(((........{(.((({(.(((((((((((((.(((..((....{.(((((.((((((((((,(,.((((.((((.{(((..((.(((((..(((((((((((((((..((,((.((((..((((((,{(((((.(((((((({{(((.....,,,.|||||{{{{|{.{{}||,...{((((((,,,,.(((((({..{|.....)),)))))))(((((((((((......)))}}))))))).)})}}}),,.}},|}..})))}})))))))))))))))))}}}))...{((((((((((,((({{,(((({(((((,......(({(({.(((({{{{.,,||,,||||}||,},...}}}},,,,},.}}}......,,},}}}|||||..,,|,,,.},||||{,.{|.,,,,,)),))))),((((.((((.,{{((.....((((((((.((.(((((.((...)).))))).))))))))))..)))).)))).))))))))))))))),{{,.........}}||{(((((,,....}}}},},,...}}}}}))...))}))).})..)))))))))))))))..))))).}).)))}..,.{{((((..,,,.,,,||||}}},..,((((.(((.....)))))))),,,)))))))),},},.........,))))))))).))))).}.....))..))).))))))))))))}).))..))).)}...,.((((((((.....)))))))).,,.((.((.{,.,{,.(((((.((({(((.(((({((((((.,{(((({.....,}},....)))})))))).))))).)))))).))))).},,}.)).))..(((.(((((....))))).)))((((((....))))))))))))))))))))}.)))))...))))))))))))).}}|||}}}))))))}}}}.)))))))))),(((((((((.(((...........)))...)))))))))(((((......)))))))))))).))))))))(((({.(((.....})).))))){(((........)))}.))))))))))).,......)))))...))))))}.))).}.).,))))))))))}(((((..((((..((((.{((((((((,{{,(((((.....(((((.(((((....))))).).))))|||||.||||{.....(((((.(((((....))))).).))))}}}}},|||||....({((((.......,,,........,}}}}}))))))}},,(((((((.((.{((,(({((((({{((((((,..((((((((.({{(,,....((((((.((((...............)))))))))).....))).}.)))))))).,.))))))){((({...|})}}.((((.(((((((,...,))))))))))).........(((((((((...(((((({{.{{,,...|}.}},{(((....)))}..)))))).)))))))))..,))))).}},.,,({{{,,.,}}),},.})).))}.)).))))))).)),})))))}.)))).))))..)))))))))))))))......))))))))))))))))..)))))))))))))).)))(((((,((,((,({{{{{.,,,...)))))).)).}}.))))),,,,,,....,,,.,})))}.}}.})}}}}))}),))},,,,.,{(({{,.|||{....|}}|},.......{{{{{{.{{{{|{{((((......)))))),,...|,,,,,,,,}}}}}}),},)))))),}}}})}|||||||,|||,}..,}}}},..}),))))).}}|}))}.,}},..,,,,,,,..,},,.,.)}))).....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 6425 nt 0.4307
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 6365 nt 0.3892
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 5894 nt 0.3653
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 5898 nt 0.3652
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 6553 nt 0.4319
GUCCUCCGGGGAUUAGAGCCGGUGGGCUCGUUGUGGGCGCCAUUUCUCG… 6556 nt 0.4320
Summary

Predicted to enable cytoskeletal protein binding activity and protein domain specific binding activity. Predicted to be involved in actomyosin structure organization. Predicted to act upstream of or within several processes, including chordate embryonic development; embryonic foregut morphogenesis; and mesoderm morphogenesis. Located in cytosol; nucleoplasm; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.