Basic Information

Symbol
EPHX2
RNA class
mRNA
Alias
Epoxide Hydrolase 2 ABHD20 SEH Epoxide Hydrolase 2, Cytoplasmic Bifunctional Epoxide Hydrolase 2 Bifunctional Epoxide Hydrolase Epoxide Hydrolase 2, Cytosolic Epoxide Hydrolase, Soluble Soluble Epoxide Hydrolase Epoxide Hydratase CEH
Location (GRCh38)
8:27490775-27548992
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001979.6
Sequence length
2776.0 nt
GC content
0.5331

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1001.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1054.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 816.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256482.2 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2738 nt 0.5336
NM_001256483.2 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2691 nt 0.5336
NM_001256484.2 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2774 nt 0.5332
NM_001414016.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2686 nt 0.5268
NM_001414017.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2439 nt 0.5055
NM_001414018.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2330 nt 0.5249
NM_001414019.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2035 nt 0.5199
NM_001414020.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 2008 nt 0.5224
NM_001414021.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 1934 nt 0.5202
NM_001414022.1 NCBI
GCCCUGGCCUUCGCGCAUCUCCCAGGUUAGCUGCGUGUCCGGGUGCUAG… 917 nt 0.5529
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

This gene encodes a member of the epoxide hydrolase family. The protein, found in both the cytosol and peroxisomes, binds to specific epoxides and converts them to the corresponding dihydrodiols. Mutations in this gene have been associated with familial hypercholesterolemia. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that major blunt trauma triggers a selective alteration in gene expression within circulating leukocytes, with the EPHX2 being among the top ten down-regulated genes following injury [Brandfellner et al. DOI:10.1097/SHK.0b013e31829de02f]. A study in mice demonstrated that the EPHX2 was down-regulated in liver tissue following Kupffer cell-specific and endothelial cell-specific exposures to α-particles, and this down-regulation was also observed after γ-ray exposure, identifying it as a gene with characteristic expression changes in response to radiation compared to hepatotoxicants [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].