Basic Information

Symbol
EPOP
RNA class
mRNA
Alias
Elongin BC And Polycomb Repressive Complex 2 Associated Protein PRR28 C17orf96 Elongin BC And Polycomb Repressive Complex 2-Associated Protein Proline-Rich Protein 28 Proline Rich 28 LOC100170841 Chromosome 17 Open Reading Frame 96 Uncharacterized Protein C17orf96
Location (GRCh38)
17:38671703-38674957
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001130677.2
Sequence length
3255.0 nt
GC content
0.6406

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1519.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1570.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 561.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130677.2 NCBI
AGUUCUCUAUAACGCGGUCUCCGGGAGCCAGCGGGGAAGAAAGAAACCG… 3255 nt 0.6406
Summary

Predicted to enable chromatin binding activity. Predicted to be involved in neuron fate commitment; regulation of transcription by RNA polymerase II; and stem cell differentiation. Predicted to be located in chromosome and nucleus. Predicted to be part of ESC/E(Z) complex and elongin complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that EPOP was part of an upregulated pathway associated with pluripotency in female versus male E7 embryos, as identified through whole transcriptomic analysis of untreated C57BL/6J mouse embryos [Boschen et al. DOI:10.1002/Bdr2.2292].