Basic Information

Symbol
EPS8L2
RNA class
mRNA
Alias
EPS8 Signaling Adaptor L2 Epidermal Growth Factor Receptor Kinase Substrate 8-Like Protein 2 Epidermal Growth Factor Receptor Pathway Substrate 8-Related Protein 2 EPS8-Related Protein 2 EPS8 Like 2 FLJ21935 FLJ22171 MGC3088 EPS8R2 EPS8-Like Protein 2 EPS8-Like 2 DFNB106
Location (GRCh38)
11:694438-727729
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022772.4
Sequence length
3030.0 nt
GC content
0.6347

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1328.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1375.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 924.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((.((((..((((((.((((((..(.(.(.(((.((((((((.(((((.......))))).))))....)))).))).).))..))))))))))))...)))).)))((.((((..(((((((((..(((((((.(((((((((((((((((((((((((((....))))).))))))).(((((...((...(((((...)).)))))..)))))......))))).((((......)))).........(((.((......))))).((((........(((((.....((....)).......)))))....))))..........(((((((.(..((((.....(..((((((((.(((((((((...(((((.(...(((...(((((((((((((((((((((.((((.(((.((((((((.(((((((............((((((((.(((.((((..((((((((..((((.((((((.(((.((..((((((.(((((((..(((...((((((.(((..(((((.(((.((.......)).)))))))))))))))))((((((((.((......)).)))))))))))..)))))))....)))))).))..).)))))))))))).((((.(((((.(........).)))))))))..((((.........)))).........)))))))).))))..))).).)))))))...((((.....)))).......)))))))))))))))((....))(((((((((((((...((((((((((((.((((((((((.(((...........)))((((.((.(.((((((((((...(((.......((..(((........)))..))...)))...)))))..)))))).)).)))).....)))))(((((.(((((((((((.....))))))).))))..))))).((((...)))).......((((..((((.((.....(((..((((..(((((((((((((........))).)))....)))))))..))))..))).....)).))))...........((((((((.....))))))))...(((.....)))..........)))).))))))))).))))))))......))))..)))))))))..))).))))...)))))))))))))..................)))))))).)))...))))))(.((..((((((.(.....).))))))...)).)(((((..((((.....(((..((((((...((((...(.(((((.((.((((((((((.((.(((((((..((((....(((((((((((.(((((((...((((((...((((((.((((.(((((((((((((((..((((((((((.(((.(((((.(((((((((.((((..........((((.....((..(((.((.....)).)))..))..)))))))).)).)))))))..........))))).))).)))))....))).))..))).........))))).).)))))))))).))))))..(((..(((..((((..((.(.((.((..(((.((.(((((((((((((((...((......))..)))).)))....).))))))).)).)))..)).)).)))))))))).)))))))))((((((....)))))).((((((((((((....)))))))......)).)))).))))))...))))).....))))))..))))..)).))))).)).)))....))))))).))))))).)..))))...))).)))...))))))).)))))........))))))).)).))))..(((.(((.((......)).))).))).......))))..).....))))..))))))))(((.((((.((.((((((.......((((((((((.....)))))).........((((.(...((.((((((((...(((((((.((....)).))))))))))))))).))..).))))))))..(((..(((((((.((((((((((..........))))))))))......(((((..((((((.(.(((....))).).(((((.((.......))....((((..(((((((...((((.((((((((.((...((((((((((........)))))..))))).........(((.(((((((.(..((.((((((((((......)))).))))))(((.((((((.(((....((.((((((((..((((.......))))...)))))))).))......(((((....((((((.((((((.((((.((((((..((((((.....)).))))....(((........)))..............))))))))))..(((((((........((((.......))))))))))))))))))))))))))))..........((((((.(((..((....))..))).)))))).......))).)))))).))).....((((((....))))))))..).))))))).))))))))))))).......(((((........))))).))))...)))))))..)))).)))))..)))))).)))))((((....)))).(((....))))))))))..))))))))))).)))))))((((((((.....(((((...((((((............))))))(((...((((((.....(((.((....)).))))))))))))...))))).)))))))).))))).))))).))))))).....((..(((((........)))))..))......)))))))))..)))))).)))))))))((((((((.(.((....(((((.(.....).)))))...)).).))))))))(((((.(((..........))).))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,((((((((((((.((((..((((((.((((((..{.{.,.(((.((((((((.(((((.......))))).)))),...}))).))).}.}}..))))))))))))...)))).)))(,{((((..(((((((((.,(((((((.(((((((((({{(({((((((((((((....))))}.))))))).{((((,..(({{{(((({.,.||.}}},,..|||||{((,.,{|}}}.((((......))))..||,..,|(({.{{..,...}}}}}.,,}}}},..,.,||||,||,,|||||||}}}|,.||.|||}}..,,||,.,||{,||,,.{{({(((.{..{{||.,.,,|..((((((({.(((({{(((,..(((({,{...(((...(((((((((((((((((((((.((((.(((,((((((((.(((((((....,.......((((((((.(((.((((..((((((((..((((.((((((.(((.((..((((((.(((((((..(((...(((((({(((.(((((({.((......)).}}))))))))))}),))))))((((((((.((......)).)))))))))))..)))))))....)))))).))..).)))))))))))).(((,{(((((.({.......).))))))))).,((({..|,.....)))).,.....,,)))))))).))))..))).),}))))))...((((.....)))).......))))))))))))))|((,...))|((((((((,,({...((((((((((((.(((((|{{{{.|||},,,.,,{{{((({((((,((.(.((((((((((...(((..,,.,.((,.(({........)}}..}},..)))...)))))..)))))}})).))))...,,,|||,(((((.(((((((((((.....))))))).))))..))))).||||,..,,))}}},,..((((..{..,..{{((,,(,.,,((((,,({({((({({{{{{.....|.||||,,,}}}}}}}||||.|||||{({|,.,,|,}|||||,,,|,.......||||||||,...}))))|||,...(((,....)))....}},,..}})).))))))))).))))}}))..,,,.}))}..))))))))),.))).))))...)))))))))))))...,.........,...,)))))))).}||,..||||}},.,|..{{{(({,{...,,|.}}}|||,..,||}|{{{,.,||||..|,,{{({|((({{{...((((.,.(.({{{{.{(,((((((({{{.{{,{||||||{{(,(({...{{{{||{{||{.{{{{|||..,||||||,}}((((((.,(((.((((((({(((((((,.((|((((((({(((.(((((.(((((((((.((((,{,{,.....}}.|}.{{{((..(((.({.....)).)))..)}.,))),)))).)).))))))).,,....,,.))))).,))})))))..}})}}.}}..))),,..,....})))).,,)))))))))}.))))))..{(({|(((..((((..((.(.((.((..(((.((.((((((({(((((((...((......)),.)))).)))....).))))))).)).)))..)).)).)))))))))).,))))),..((((((....)))))),((({{(((((((....))))))).....,}}.||||.||}|||.,,||}}}...))))))))}}))},..}}.))))|,||,||},...,||||||{|,|||||{|,,||||,..|||.,,,....||||||{|||},........}}||}}}.}}.}}}}.{(((.(((.((......)).))).)))}......}}))..,.....|||}..)))}}}}|(((.((((.((,((((((,,.,,..{{{{((((((.....))))))....,.{{(((((,({{.({.((((((((...(((((((.((....)).))))))))))))))).))..}.,))))))}..{||..|{||(((.((((((((((,{........))))))))))......{((((|,{((,((,,,|{.}}},}}}|}.||||,.||}..,}}})).}},||||,,|||||{|,,,||||.,,||||||}||.,}|||{,{{{{(,,,,....}}}}},.}}})),},.,,,,,((({((((((({,,.(({,((({{{{{{....,{|||||||||||{,((.((({...}}}.,}|{.((((((((.{{(((.......)))).}.)))))))}.}},.....((,{..,{((((((({(,(((({,{(({(((({,..,|||||..}}})).))))}.,}|||}..}},,.}})}.........,..,))))))))))},(((((((........((((.......))))))))))))})))}))})))),))).}}}}}}},,||((((.(((..,,..}})}}})))}))))))...,,}})))}}|||||||}}.,,||||||||..,,)))))||||.|,}||||||,|||||||||||}}......,(,{{{.,,,,...})))).||||,,,||||}}},.||||.|||,|,{|||}||.}}},,||{|.,,,)}))|(((...,)))))))}))..))))))))))).)))))}}||||||{{.....|||||...{|||||},..,.}.,...,}}},|{{|...|{((((.....(((.((....)).))))))))}},}...)))))}))))))}}.}}}}}.))))).))))))).....((..(((((........)))))..))......)))))))))..)))))).)))))))))((((((((,(.((....(((((,{.....}.)))))...)).).))))))))(({{(,(,,..,,,..,,.}},.,)))).......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022772.4 NCBI
AGACGGACGCACCGGCGAGCGCCGAGGGGACAGGCCGAGCGCGGGGCGC… 3030 nt 0.6347
Summary

This gene encodes a member of the EPS8 gene family. The encoded protein, like other members of the family, is thought to link growth factor stimulation to actin organization, generating functional redundancy in the pathways that regulate actin cytoskeletal remodeling. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived mesenchymal stem cells (MenSCs) from women with endometriosis demonstrated that the EPS8L2 protein was downregulated in endometriosis MenSCs compared to controls [Penariol et al. DOI:10.3390/ijms231911515].