Basic Information

Symbol
ERAP2
RNA class
mRNA
Alias
Endoplasmic Reticulum Aminopeptidase 2 L-RAP LRAP Leukocyte-Derived Arginine Aminopeptidase EC 3.4.11.- EC 3.4.11.3 EC 3.4.11
Location (GRCh38)
5:96875986-96919703
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022350.5
Sequence length
5131.0 nt
GC content
0.4019

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1387.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1486.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1570.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130140.2 NCBI
CCCAACUCAAACAGGCAGAUAAAGAGAGAUCAAAGAGAUGAGCAUGAGA… 5285 nt 0.4023
NM_001329229.1 NCBI
CCCAACUCAAACAGGCAGAUAAAGAGAGAUCAAAGAGAUGAGCAUGAGA… 5587 nt 0.4040
NM_001329233.1 NCBI
CCCAACUCAAACAGGCAGAUAAAGAGAGAUCAAAGAGAUGAGCAUGAGA… 1894 nt 0.4081
NM_022350.5 NCBI
AGUCAAAUCUGCAGCAGCAUGAUUUAAGAUUAAAUUCAUGUAUUGAAAA… 5131 nt 0.4019
Summary

This gene encodes a zinc metalloaminopeptidase of the M1 protease family that resides in the endoplasmic reticulum and functions in N-terminal trimming antigenic epitopes for presentation by major histocompatibility complex (MHC) class I molecules. Certain mutations in this gene are associated with the inflammatory arthritis syndrome ankylosing spondylitis and pre-eclampsia. This gene is located adjacent to a closely related aminopeptidase gene on chromosome 5. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ERAP2 is a hub gene in a brain co-expression network negatively correlated with voluntary alcohol consumption [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].