Basic Information

Symbol
ERBB3
RNA class
mRNA
Alias
Erb-B2 Receptor Tyrosine Kinase 3 HER3 V-Erb-B2 Avian Erythroblastic Leukemia Viral Oncogene Homolog 3 Tyrosine Kinase-Type Cell Surface Receptor HER3 Human Epidermal Growth Factor Receptor 3 Receptor Tyrosine-Protein Kinase ErbB-3 Proto-Oncogene-Like Protein C-ErbB-3 EC 2.7.10.1 LCCS2 Lethal Congenital Contracture Syndrome 2 P180-ErbB3 P45-SErbB3 P85-SErbB3 EC 2.7.10 MDA-BF-1 C-ErbB-3 C-ErbB3 ErbB3-S ErbB-3 FERLK VSCN1
Location (GRCh38)
12:56076799-56103505
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001982.4
Sequence length
5615.0 nt
GC content
0.5126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1957.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2060.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1541.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005915.1 NCBI
ACACACACACACCCCUCCCCUGCCAUCCCUCCCCGGACUCCGGCUCCGG… 1050 nt 0.5629
NM_001982.4 NCBI
GCAAUUUGCAACCUCCGCUGCCGUCGCCGCAGCAGCCACCAAUUCGCCA… 5615 nt 0.5126
Summary

This gene encodes a member of the epidermal growth factor receptor (EGFR) family of receptor tyrosine kinases. This membrane-bound protein has a neuregulin binding domain but not an active kinase domain. It therefore can bind this ligand but not convey the signal into the cell through protein phosphorylation. However, it does form heterodimers with other EGF receptor family members which do have kinase activity. Heterodimerization leads to the activation of pathways which lead to cell proliferation or differentiation. Amplification of this gene and/or overexpression of its protein have been reported in numerous cancers, including prostate, bladder, and breast tumors. Alternate transcriptional splice variants encoding different isoforms have been characterized. One isoform lacks the intermembrane region and is secreted outside the cell. This form acts to modulate the activity of the membrane-bound form. Additional splice variants have also been reported, but they have not been thoroughly characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for ERBB3 Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated a significant positive correlation (r²=0.5345; p<0.0001) between blood lead levels and plasma mRNA expression of the ERBB2 gene in healthy male refinery workers [Ferrante et al. DOI:10.3892/Mmr.2017.6382].