Basic Information

Symbol
Erbin
RNA class
mRNA
Alias
Erbb2 Interacting Protein LAP2 Densin-180-Like Protein ERBB2IP Protein LAP2 Erbin Epididymis Secretory Protein Li 78 ERBB2-Interacting Protein Erbb2-Interacting Protein HEL-S-78 KIAA1225
Location (GRCh38)
5:65883128-66082546
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001253697.2
Sequence length
8544.0 nt
GC content
0.3574

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2023.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2202.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2233.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001006600.3 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8214 nt 0.3529
NM_001253697.2 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8544 nt 0.3574
NM_001253698.2 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8346 nt 0.3560
NM_001253699.2 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8565 nt 0.3583
NM_001253701.2 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8409 nt 0.3559
NM_018695.4 NCBI
GGCGGAGAUCCUCGUUGGGGCUGGGAAACUCCUGCAAAACUCGAGACCA… 8421 nt 0.3563
Summary

This gene is a member of the leucine-rich repeat and PDZ domain (LAP) family. The encoded protein contains 17 leucine-rich repeats and one PDZ domain. It binds to the unphosphorylated form of the ERBB2 protein and regulates ERBB2 function and localization. It has also been shown to affect the Ras signaling pathway by disrupting Ras-Raf interaction. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.