Basic Information

Symbol
AHRR
RNA class
mRNA
Alias
Aryl Hydrocarbon Receptor Repressor BHLHe77 KIAA1234 Class E Basic Helix-Loop-Helix Protein 77 AHR Repressor AHHR AHH Aryl Hydrocarbon Hydroxylase Regulator Aryl Hydrocarbon Receptor Regulator Aryl-Hydrocarbon Receptor Repressor Dioxin Receptor Repressor AhR Repressor BHLHE77 AhRR
Location (GRCh38)
5:320682-438291
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001377236.1
Sequence length
5661.0 nt
GC content
0.5787

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2292.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2384.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1137.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001377236.1 NCBI
GCCGCGGGUUCCCGGGAUGCGAGCGCCGGCACCCGCCGCCACAGCUCCU… 5661 nt 0.5787
NM_001377239.1 NCBI
ACAGCCGCCCCGGCCUGGCAACCGUCACCCAUUUUACGAACGAGGACAU… 5608 nt 0.5744
Summary

The protein encoded by this gene participates in the aryl hydrocarbon receptor (AhR) signaling cascade, which mediates dioxin toxicity, and is involved in regulation of cell growth and differentiation. It functions as a feedback modulator by repressing AhR-dependent gene expression. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011]

Forensic Context

A study in humans using integrative machine learning on multi-level molecular data from monozygotic twin pairs identified the AHRR as having lower methylation in heavier twins with less leisure time physical activity and associations with dietary sucrose consumption [Kibble et al. DOI:10.1098/rsos.200872]. Another study in humans analyzing peripheral blood transcriptomes from individuals with substance use disorders found the AHRR had significantly increased gene expression in the case group [Yakovchik et al. DOI:10.1016/J.Jpsychires.2025.09.061]. A review of CRISPR-Cas applications in forensic sciences notes that the AHRR exhibits significant hypomethylation in smokers, representing an epigenetic marker for lifestyle exposure assessment [Sobral et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2024.103163].