Basic Information

Symbol
ERF
RNA class
mRNA
Alias
ETS2 Repressor Factor PE-2 PE2 ETS Domain-Containing Transcription Factor ERF Ets2 Repressor Factor CHYTS CRS4
Location (GRCh38)
19:42247569-42255131
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006494.4
Sequence length
2672.0 nt
GC content
0.6388

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1257.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1303.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 899.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001301035.2 NCBI
GUGCGGGGCGGGGGGGCUCGUCCACCGGGCCCGCUAUCCCUGGUUCUGC… 2620 nt 0.6340
NM_001308402.2 NCBI
GUUUCCUUCCCCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCUCGGGCUCC… 2579 nt 0.6336
NM_001312656.2 NCBI
GAGAGGCUCUGAGAGGCGAGGCCGGGGUUUGCCUUCCCGGAUUGGGCCU… 2546 nt 0.6300
NM_006494.4 NCBI
GAGAGGCUCUGAGAGGCGAGGCCGGGUGAGGCGGCGAGGGCGGCCCGAC… 2672 nt 0.6388
Summary

ETS2 is a transcription factor and protooncogene involved in development, apoptosis, and the regulation of telomerase. The protein encoded by this gene binds to the ETS2 promoter and is a strong repressor of ETS2 transcription. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.