Basic Information

Symbol
ERGIC1
RNA class
mRNA
Alias
Endoplasmic Reticulum-Golgi Intermediate Compartment 1 ERGIC-32 ERGIC32 KIAA1181 NET24 Endoplasmic Reticulum-Golgi Intermediate Compartment (ERGIC) 1 Endoplasmic Reticulum-Golgi Intermediate Compartment Protein 1 ER-Golgi Intermediate Compartment 32 KDa Protein Endoplasmic Reticulum-Golgi Intermediate Compartment 32 KDa Protein AMC2 AMCN
Location (GRCh38)
5:172834251-172952792
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001031711.3
Sequence length
2903.0 nt
GC content
0.5450

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1061.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1115.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 655.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001031711.3 NCBI
ACUUCCCGGCAGCGGGAGGCGAGUGGCGAGUGGCGAGUGGCGAGUGUCA… 2903 nt 0.5450
Summary

This gene encodes a cycling membrane protein which is an endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment (ERGIC) protein which interacts with other members of this protein family to increase their turnover. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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