Basic Information

Symbol
ERLEC1
RNA class
mRNA
Alias
Endoplasmic Reticulum Lectin 1 XTP3TPB CL25084 C2orf30 XTP3-B XTP3-Transactivated Gene B Protein Erlectin 1 ER Lectin ERLECTIN Cancer Invasion And Metastasis-Related Chromosome 2 Open Reading Frame 30 Epididymis Luminal Protein 117 XTP3-Transactivated Protein B Erlectin CL24936 HEL117 CIM
Location (GRCh38)
2:53787009-53833038
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015701.5
Sequence length
2446.0 nt
GC content
0.4150

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-715.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -764.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 596.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127397.3 NCBI
GGAGGCGGCGUUGCCGGGCUCUCCGGAAGGAGACGUGGCGGCGGUUGGG… 2368 nt 0.4177
NM_001127398.3 NCBI
GGAGGCGGCGUUGCCGGGCUCUCCGGAAGGAGACGUGGCGGCGGUUGGG… 2284 nt 0.4137
NM_015701.5 NCBI
GGAGGCGGCGUUGCCGGGCUCUCCGGAAGGAGACGUGGCGGCGGUUGGG… 2446 nt 0.4150
Summary

This gene encodes a resident endoplasmic reticulum (ER) protein that functions in N-glycan recognition. This protein is thought to be involved in ER-associated degradation via its interaction with the membrane-associated ubiquitin ligase complex. It also functions as a regulator of multiple cellular stress-response pathways in a manner that promotes metastatic cell survival. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 21. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the ERLEC1 in microglia, where it is involved in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].