Basic Information
Symbol
ETFA
RNA class
mRNA
Alias
Electron Transfer Flavoprotein Subunit Alpha
MADD
GA2
EMA
Electron Transfer Flavoprotein Subunit Alpha, Mitochondrial
Multiple Acyl-CoA Dehydrogenase Deficiency
Glutaric Aciduria II
Alpha-ETF
Electron-Transfer-Flavoprotein, Alpha Polypeptide
Electron Transfer Flavoprotein, Alpha Polypeptide
Electron Transfer Flavoprotein Alpha Subunit
Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Location (GRCh38)
15:76188555-76311730
Forensic tag(s)
Individual identification
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_000126.4
Sequence length
2289.0 nt
GC content
0.4377
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-697.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-746.15 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
441.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AUUAGGUGACUGGCUGAGGCGGCGCCAGUUGGCCGGGCACGGGGCUGCU… | 2289 nt | 0.4377 | |
| AUUAGGUGACUGGCUGAGGCGGCGCCAGUUGGCCGGGCACGGGGCUGCU… | 2142 nt | 0.4360 |
Summary
ETFA participates in catalyzing the initial step of the mitochondrial fatty acid beta-oxidation. It shuttles electrons between primary flavoprotein dehydrogenases and the membrane-bound electron transfer flavoprotein ubiquinone oxidoreductase. Defects in electron-transfer-flavoprotein have been implicated in type II glutaricaciduria in which multiple acyl-CoA dehydrogenase deficiencies result in large excretion of glutaric, lactic, ethylmalonic, butyric, isobutyric, 2-methyl-butyric, and isovaleric acids. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the ETFA was downregulated in the adipose tissue of heavier co-twins within BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its involvement in mitochondrial metabolism in acquired obesity [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226]. In a separate human study, the ETFA was identified as a single-gene blood biomarker capable of differentiating methamphetamine dependents without psychosis from those with methamphetamine-associated psychosis [Breen et al. DOI:10.1038/tp.2016.67].