Basic Information

Symbol
ETNK1
RNA class
mRNA
Alias
Ethanolamine Kinase 1 EKI1 EKI EKI 1 Putative Protein Product Of Nbla10396 EC 2.7.1.82 Nbla10396
Location (GRCh38)
12:22625075-22690665
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018638.5
Sequence length
7063.0 nt
GC content
0.3401

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1701.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1854.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1998.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039481.2 NCBI
GCGGCCGCCCGCGGUCCAGCUCCGACAACAGGAAUUUUCUCCGAGAGCG… 1576 nt 0.4296
NM_018638.5 NCBI
GCGGCCGCCCGCGGUCCAGCUCCGACAACAGGAAUUUUCUCCGAGAGCG… 7063 nt 0.3401
Summary

This gene encodes an ethanolamine kinase, which functions in the first committed step of the phosphatidylethanolamine synthesis pathway. This cytosolic enzyme is specific for ethanolamine and exhibits negligible kinase activity on choline. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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