Basic Information

Symbol
ETV3
RNA class
mRNA
Alias
ETS Variant Transcription Factor 3 PE-1 Ets Variant Gene 3, ETS Family Transcriptional Repressor ETS Domain Transcriptional Repressor PE1 Mitogenic Ets Transcriptional Suppressor ETS Translocation Variant 3 METS PE1 ETS Variant 3
Location (GRCh38)
1:157121191-157138474
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145312.3
Sequence length
5282.0 nt
GC content
0.4544

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1693.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1785.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1373.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145312.3 NCBI
ACUUCCUGCUGGGGUGGAUGAGGAGGAGCCGGAGACGCCGCGGAGGAGA… 5282 nt 0.4544
NM_005240.3 NCBI
ACUUCCUGCUGGGGUGGAUGAGGAGGAGCCGGAGACGCCGCGGAGGAGA… 1460 nt 0.4192
Summary

Enables sequence-specific double-stranded DNA binding activity. Predicted to be involved in cell differentiation and regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ETV3 gene was upregulated in common in spleen leukocytes across three distinct injury models (trauma/hemorrhage, burn, and LPS infusion) at a 2-hour post-injury time point [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. In a separate investigation of radiation-induced skin injury, single-cell RNA sequencing analysis of human and rat skin identified the ETV3 transcription factor as being more enriched in irradiated skin cells compared to healthy cells [Yan et al. DOI:10.7150/thno.100417].