Basic Information

Symbol
AIDA
RNA class
mRNA
Alias
Axin Interactor, Dorsalization Associated Axin Interaction Partner And Dorsalization Antagonist C1orf80 Axin Interactor, Dorsalization-Associated Protein FLJ12806 Chromosome 1 Open Reading Frame 80
Location (GRCh38)
1:222668013-222713210
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022831.4
Sequence length
2975.0 nt
GC content
0.4044

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-804.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -863.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 976.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022831.4 NCBI
CAAAGUUUGGCUGUGGCGGCAAAUGGGCUUGGGCGGCUCCUCGGCGGGU… 2975 nt 0.4044
Summary

Predicted to enable phosphatidylinositol binding activity. Acts upstream of or within negative regulation of JUN kinase activity. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples demonstrated that the AIDA gene, which acts as a ventralizing factor during embryogenesis, was included in an up-regulated cluster and showed a positive coefficient in a post-mortem interval (PMI) prediction model [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z]. This generalized linear model with elastic net restriction, which incorporated the AIDA transcript among others, predicted PMI with a root mean square error of 4.75 hours in cross-validation.