Basic Information

Symbol
EXOC3L1
RNA class
mRNA
Alias
Exocyst Complex Component 3 Like 1 EXOC3L Exocyst Complex Component 3-Like Protein Protein Jiangli FLJ35539 FLJ35587 Exocyst Complex Component 3-Like 1 Exocyst Complex Component 3-Like
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Chronological age estimation

MANE select

Transcript ID
NM_178516.4
Sequence length
2429.0 nt
GC content
0.6488

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1164.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1202.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((.....))))))..(((((.((.((((....)))))).)))))((..(((((((((((((..((((((((((((((..((.(.....).)).)))).((((((....((((((....))))))...))))))...))))))).)))..(((((((........((((((...(((.((((..(((((.....)))))))))..)))..)))))))))))))(((((.((((((((.((((..((((.((.(((.(((((....((((((((.((((.......((((((.((....(((((((......)))))))..(((.((.((((((((((((((((((((((((((....(.(((((((((((.((.((((..((.......))..)))))).))))(((.((.(((.....))))).)))..))))))))..))))))....(((((...((((((..((((...((((((((((.(((((.(((((.(((((..........)).))).....(((((...((((((..((....))....(((((((..(((......(((.((((((..(((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((...((((((((((.((((((((((((((........)))))))))))))).....((.(((((.(((..((((((((((((((((((((.(((.....)))))))))))))))((((.((((((((.(.((...(((((((.((((((....)))))).....)))).))).....)).).))))))))..))))(((((.(((.((((.(((((((.(((((((((((((....((......)).....((((..((((((((.((.(...((.(.((((......)))).).))...).)).))))))))..))))((((...))))))))))))))))).)))).))).))))))).))))).((((((((.((((((((.((((...)))).)).((((((((((.((((.(((....(((((.....)))))..))).)))).....)))).))))))....(((((...((.(((..((((...((((((((((((((((.......))))))(((....)))....))))))).)))..))))..))).))..))))).((((....(((..(((((((.(.(((((.((((.((((((((((..((((....((.(((((((((((((((.......((((........)))).......))))))).))).))))).))))))))).))))))).(((((.((((((.((((((((...(((.(((.(((.(.(((((.(((..((((((((....((((((........).)))))))))))))..))))).)))..).))).))).))).)))))).)))))..)))..))))).(((((.((((.((((.(((((.((((.((((........))))))))....)))))))))..)))).)))))......(((((.((...)).))))).....((((((((((((.....))).))))).)))).....))))))))).).)))))))..))).(((.(((.(((((..(((((..........((((((.((..((((((((((((((((((((((.((....)).))))))..)))......)))))))..)))).))..)).))))))........)))))..))))).))))))))))))))))))))))))..))))))))..)))...)))))))...)))))))))).....)))))........)))))))(((((.(..(((((((...((((((.....))))))...)))...)))).).)))))(((((((..(((((.(((....(((((((((((((((((((.(......).))))......((((((((((.((.((.((.......)).).).))))))))))))))))))).)))))))).....)))))))).)))))))((((((((((.......)).))))))))...)))))))).))))))))))))))).)))))).)))......(((((((.(.(((.((...)).)))).)))))))))).)))))))))))))...)))))((((((.(......)))))))...((((....)))).......))))).)))))..)))))))).)).))))..))))))))))).))))).))))))).)))).))))...)))))..)))))).))........)))))).))))))....)))))))).))))))..))))))))))(((((........)))))))))))))))))))))..........))))...)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........{(((((.,,..}}}}}}{{((((({,({,,,,..}}))))))})|}},||,.||{,(((((((({..((((((((((((((..((.(.....).)).)))).((((((....((((((....))))))...))))))...))))))).)))..{((((((........((((((...(((.(({{..(((((.....)))))}}}),.)))..))))))))))))}(((((.((((((((.((((..(((({((.(((.(((((....((((((((.((((.......{{(((({((....(((((((......))))))).,|{{.||,((((((((((((((((((((((((((....{.(((((((((((.((.((((..((.......))..)))))).)))|(((.((.(((.....))))).))),,)))))))},.))))))....(((((...((((((..((((...((((((((((.(((((.(((((.((({{..........}}.}}}.....(((((...((((((,,((.,..}|..,,{((((((,.({,......(((.((((((..(((((((((((((((((((((((,{({((((((,{((,,{.,,((((((((.((((((((((((((........)))))))))))))).....((.(((((.(((..((((((({((((((((((({{(((.....)))))))))))))))((((.((((((((.(.((.,.(((((((.|{((((|,..}}}})).,,,.)))).))).,...)).).))))))))..))}|(((((.(((.((((.(((((((.(((((((((((({....,({.....,..,},.((((..((((((((,((.{.,.((.(.((((,.....)))).).))...,.)).))))))))..))))((({...})))})))))))))))).))))}})).))))))).))))).((((((({,(((((({{,((((,..))}}.}},{{{{((({|({(({(,(((.{,.{{{|{|,,,}))))}..)))||,||.....||||||||}},.}}}|||||,..|{||{,..((({,..,|||||||{(((((((..{({{{,|||||(((,,{,|||,,.,|}|||||.|||{{},||..|||.}}..,||||,|||||.,,{{,..(((((((.(.(((((.((((.((((((({{{{,((((....{{.{((((((((((((((.......((((........)))}.......))))))).))),,)))}.}}}})),}}.))))))).,((((.((((((.((((((((...(((.(((.(((.{.(((((.(((,.((((((((,...,(((({........).)))))))))))))..))))).)))..).))).))).))),)))))).})))),..)),,})))}.(((((.((((.((((.(((((.((((.((({.,.....,))))))))....)))))))))..)))).)))))....,,(((((.((...}}.))))),,...((((((((({{(.....})).)))))))}))....,))))))))).).)))))))..},)}}))}))}}|||,|,.|||||.,||,{|,||({{{{{,{{|,(({(((((((((({(,((((((.((....)).))))))..||||,,,..,}})))),,)))).)),})),))))))}.....,,))),))})))))))).,))))))))))))))))))))..))))))))..)))...))))))}...))))))))||{{...,,)))}...,,.}))}))))}|,,,,|..{((((((...{(((((,...,)))))).},))},,,||}}.,,)))){(((((((..(((((.(((.,.,((((((((((((((((((,..}}}...|.||....))..((((((((((.((.((.((.......)).).).))))))))))))))))))).)))))))).,.,.)))))))).)))))))|(((((((((.......)),})))))),.,.)))))))).))))))))))))))).)))))).))).,....{{{{{((,(.{{{,||,..)).))))}))}))})))),))))))}))))))...}))))((((((.{....,.,))))))...((((....)))),,,..,.))))).)))))..)))))))).)).))))..))))))))))).))))).)))))))},))).))))...|||||..}))))),))........)))))).))))))....)))))))).))))))..))))))))))(((((........))))))))))))))))))))).........,)})}.,,)}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGAGAGACUUCCUUGGGGAGAGGAAUUCAGCUGCACGCUGGAGUCAGC… 2429 nt 0.6488
Summary

Predicted to enable SNARE binding activity. Predicted to be involved in exocyst localization; exocytosis; and peptide hormone secretion. Predicted to be located in secretory granule. Predicted to be part of exocyst. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood, identifying 79 differentially expressed genes (DEGs) including the EXOC3L1 which displayed non-monotonic expression trends, being higher in the middle-aged group [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].