Basic Information

Symbol
EXOC6B
RNA class
mRNA
Alias
Exocyst Complex Component 6B KIAA0919 SEC15L2 SEC15B Exocyst Complex Component Sec15B SEC15-Like Protein 2 SEC15 Homolog B (S. Cerevisiae) SEC15-Like 2 (S. Cerevisiae) SEC15 Homolog B SEMDJL3
Location (GRCh38)
2:72175984-72826051
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015189.3
Sequence length
5910.0 nt
GC content
0.4481

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1781.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1894.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1585.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((..((....))..)))))))...((((.((((((..((((((((.((((((((((((((((((.((((((.((((((..(((((.(.((((.(((.(....).)))))))).)))...))..)))((.((((.((.(((((.(((((....((((.(((..((((..((.(((.((((((((.((((((((..((((..((....((((((...)))))))).)))).)))))(((((((...........)))))))((((((.(......).))))))..(((((((...((((....((....(((((....((.((..((((((((..(((..(.((((((...))))))..)..))).....)))))))).....)).))....)))))...))..)))))))))))...................((((((..((....((((........((((...(((.((((((((((((.....((((((....)))))).....))))))........((((.(....)))))(((((((((((...((...(.((((..((.(((((........(((((......))).)).....(((((((...))))))).........((((((..(((..((..((.((((..((....((.((((........))))))..))..))))..))(((((...(((((((((((((((..(((((((...(((((((...(((((((...(((...(((((((((((((((((((((((.........(((((..(((........(((((....((.((((((....(((.......))).)))))).)).))))).......))).......(((((((...))))))).....(((((..(((...((((...(((.((((((.....)))))).))).))))..)))............))))))))))..........))))))...)))))))))))).....)))))............)))..))))))))))))))...))))))).......((.......((((.(((..(((.(((((((((((((((.....((((((((.............))))))))......)))))))....(((((..((((((((((((((.(((((..................)))))))))...........)))))))))))))))....((((((((..((((..((((...(((.((.((((.((..(((((((((.(((....(.(((((..........((((((((....((((.((......)).))))...))))))))((((((.(((((((((((.(((((..((.(.(((((((((...))))))))).).))......))))).)))))((((.....((((((((...(((((.((((((.((....)).)))))).)).))).((((((((((.(((.((..(....)..))))).....))).)))))))....))))))))......))))..((((((........))))))....(((.(((((...........((((((..(((((....((((((...(((.....)))..(((((..(((((.(((....))).)))))..)))))(((((....))))).....(((((....))))).....((((........))))..((((((((((((...((..(((((..((......))..)))))..)).....))).)))))))))..................)))))).(((.(((((.((((((((((.....................)))).)))))).))).))...)))........)))))...))))))..........))))).)))...)))))).)))))).......................))))).)..)))..(((((((.((((..((((((.....(((((((.((((((...((((((....(((((.......)))))........)))))).)))))).........(((((((......((((((......)))))).........((.(((((.(((((((.((((((((.((.......)).)))))........))).))))))).))))))).((((.......))))..)))))))(((((...)))))(((((((..............(((......))).((((..(((((((((.(((((..((..(((((((((..((((......))))........(((((......)))))(((((.........)))))...((((((....))))))))))))))).)).))))).))..)))))))..))))))))))).(((((((.........((....)).(((((.....(((....(((((...((((((..........))))))..)))))......))).....))))))))))))(((((((..((((((((((((.....((((((.(((((((((((((((.(((((((((...........)))))))))...))))))))))((((....))))))))).)))..((((.(((((.....))))).))))((((((((.((((((....(.(((((.......(((((.........))).)).......))))).))))))).)))))))))))..)))))).)).)))).))).)))).(((....)))((((.....)))).((((...))))((((((.((((((.........))))))))))))..))))))).((((....))))..)))))).))))))))))).......)))))))))..)).)))).)))))(((((((....(((...(((((........)))))))))))))))))))))))..))).))))))))))))).))).))).)))).......))...)))))))).)))))))..))))).))..)))..))))))....((((((((((.......(((((..(((((...((((((((....)))))..(((((.((.((((.((((((..........(((((((.((((..(((((......((((((.........))))))...)))))......)))).)))..))))((((....((((((((.(.(((.(((...(((((((((((((((..((((((((((....(((((((((..(((.......((((((.((((.(((...((((((((((...(((((((((.(((((((((((.((.((((((((((((((....((((((.........(((.((((.....))))..)))........((((((.((((((.((((......((((.((((.(((((..((((((..((((...((((((.......(((........))).......))))))...........((((((((...))))))))...(((((((((..((((((..........((((((....)))))).........))))))..))).))))))....)))).)))))).((((.((...((...(((.((((((((((.(.(((((((((.......(((((.(((.(((((....)))))))))))))(.((((..((((....(((.(((((((.((((((((((...)))))))))).))((((((.(((...)))(((((((((((((((((((((.(((.((((....)))).)))(((.....)))..(((....((((.((((((..........(((((((.(((((((.......)))))))..((((((.....((((.(((((((((((((...((((.....))))....)))))..)))))).....((((((((.................((((((((((((............))))))))))))))))))))...)).))))......)))))).......(((.....))).((((((((((((((..((((((((((.((((((....(((((.............))))).......)))))).))..(((((((((..(((......)))))))))))).........)))).))))))))(((((.....)))))....((((((((.(..(((........)))..)...))))))))))))))))))..)))))))....((((((((((((...))).))).))))))...)))))).))))....)))..))))))))))).))))))..))))))))))(((.....)))..((((......)))).))))))))..))))....)))).)((((.((((((((..((((....))))))))))..............(((.((((......)))).)))..........((((.(((((..........(((.(((((..((((.(((((.((((.......))))))))).))))..)))))..)))))))).))))..)).))))))))))))).).))))))))))))).))...))))))..))))).)))))))))))))))))))))))).......))))))..)))))).))).))))).))..)))))..)))).......)).))))))))).....))))........)))))).....))).)))).))))))........)))..)))))))))..(((((((.(((..(((..((.......((((((((((....))))))))))((((.....))))))..)))..))))))))))......)))....)))))))..)))...))))).......)))))))))).))).).))))))))...)))).(((((((.....((((.((((((((((((((.(((.((((((((...(((((.....((((((((..(((((........(((......))).......(((...(.((((.....)))).)...)))......(((((((((((.....)))))))))))(((......))).)))))...)).))))))...(((((((...(((((...(.(((((((..((((((((((......))))))).......(((((.((((.................(((.(((((...))))).))))))).))))))))..))))))).).....))))).....)))))))...))))).....((((((....((((.........)))).......)))))).)))))))))))............)))))))..)))))))))))...)))))))....)))).)))))).)).)))))....))).))))).)))))(((.((((.....(((....)))..)))).)))..))))))))))))))).)))))).).))))).)))))))).)))))).)))...))))..))))....))))))))))).))))).))).))).)).))))..))).))))))))).))))).)).))))))..........))).)))))).))))).))))))))..........((((((((((....))))))))))........(((.(((((..(((..(((((((((......((((((((.(((........))).)).))))))))))))).....))..)))..))))))))..........)))))(((...((((((((((..((((......))))...)))..)))))))....)))....((..(((((......)))))..))....))))).)))..))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((..((....))..)))))),...((((.((((((..((((((((.((((((((((((((((((.((((((.{{,(((..(((((.(.((((.(((.(....).)))))))).)))...))..))){{,((((.((.(((((.((((({...(((({,((.{((((.,((.(((.((((((((.((((({,,,,((((..,{....((((((...)))))),,.||||{|||||(({{{(({(,,.{{{{..|||||}}((((((.(......).))))))..(((((((,..{(((....((....(((((....((.((..((((((((..(((..(.((((((...))))))..)..))}.}}..}))))))).....)).))....)))))...))..)))))))))))...,,,....}},......,{{(({.,(({.{(((({...(({,{{{{({(({((..(((((((((((.....((((((....)))))).....))))}}........((((((((((...((((((((((.((.(((((.(((((((,...{(((({........{((({......))).}}.....(((((((...)))))))....{{,.,((((({..{({..,(((((((({..,{{...,}}}))))))))....,.,,,,,..|,{{{.....}}|......(((((((((((((((..(((((((...(((((((...(((((((...,,{...(((((((((((((((((,,{((({.{,,,..(((({{,.(,......,{{(,..,..,.((,(((({(,{{,.,({,,,,,.,}|.}|}}}}.},.||||.....,},)}}.......(((((((...))))))).....,,,||..(((..,((((...{{|,|||{{||,,,)))))}),))),)))),,}},...,,......,})).,)))))})......,,)}))))...)))))))))))).....)))))............)))..})))))))))))))...))))))).......((.......((((.(((..(((.(((((((((((((((.....((((((((..,..........))))))))......))))))),,,.(((((..((((((((((,,(({((((,..}}}}}}}.,{{,,...},}|},,,),....}}},,.})))))))))))))).,..(((((,.(((((((..((((...(((.((.((((.((..(((((((((..,.,{,..{(((({,{(({.((((((((((((....((((.((......)).))))...))))))))....||||({{{({(((({(((....{(((((((((((({...}))))))},,{{||{|,,....,{(,({{{{{{{{{{...((((((((...(((,{.((((((.((....)).)))))).}}.))).((((((((((.,{.,{{..(....}..}})}}.....)))}}))))))....))))))))........,,..((((((........))))))....,|||||||{}}|||||{,(((((({...,{{{{......,,,,,..,{|.....,},..(((((,,(((({.,||},,,,}}.|||||,,|}}}|{({,,....|||||{,,...,,{{,||..}}}}||...,,{({{{,,...|||}..,|||||||||((,,.((,,,{{{{..,,.....,||,.||}}|{{||{....|||,|||||||||{....,,,..........,,,}||{.,..}}|||}||||,{((((,,{.........,,,,...,.|,,}.))})))})||,|,|,{{,|,,.....,,}}}}}...|||,||.......{((((((((((((({.(((((((({........,,,,........}...((((.{{.(((.((((((.....))))))))).}}....)))).....((((((...((((((....{((({,{.....,})})}}......)))))).))))))..(((,...,(((((.......((((((......))))))......)))))}))),,.)))))|}))}.}..}})))}..,))))))))|,{{{(....)))).},(|((,{{(((..{,{{{,...,}},},)),},.}})).((((|...}))))(((({({..,.,,........(((......))).((((,,(((((((((.(((((..{{..(((((((((..{(((......)))}........(((((......))))){{(((.........))}))...((((((....))))))))))))))).)).))))).))..})))))).,)))))))))}}.||||{{|},.,}}},,||,...}}.{{{((.....({,...|||{||...{(((((..........)))))).,))))}...,,,))}....,}}))}}}}}}}}|||||||,.,||,|||||{||,,...{{{{{{.(((((((((((((((.(((((((((..,.....,..)))))))))...))))))))))((((....))))))))).}}}.{((((.(((((.....))))).))))|{{{{{((.((((((......(((({....,..{{,,,..........,}.)),}}.,.,))))).}}}}}}|.|}}}})}}},}.,)))))).))))))..,,)}))))}|||....})}((((.....)))).......((((.((((((.((((((.........))))))))))))))))..{,,.((({{{,.}}|},}))).))))},},,)))})..},,..)))))))))..)).)))).))))){((((((,...{{...{(((((........)))))))))))))))))))))))})))..)))))}))))))).))).))).)))).......))...)))))))).))))))).,|..,|||,..,))..)))))),,.,))}}},))))))))))))).)))))}}.,{{,{..{{{{|,,,.}}}}}.,|{{...,{{...{{|{{,.,,,}|||||},...,,{{,,|{{|}|{{{{......((((((.........))))))...}})))..,,,))))))))))})))))))))...{{,,,,,({({(,{.,,.{({.,,|||{,|||,|||}},||||||,,|||||||..(({{{,{{{,..,,,|}||..}})}}}{{(((((.(((((((({....||}}}|.|)}.}}})}||{||..|.{(({(({(((((({{{..((((((.........(((.((((.....))))..)))........((((((.((((((.((((......((((.((((.(((((.,(,,.,,.((((((({({{,{{,,,,{.,{{{,,,...,,|||{{(.....,,))).,},.,.....((((((((...))))))))...(((((((((..((((((...,......((((({....}))))).....,...))))))..))).)))))),,|,|||}||||||(({((({.{||||{,,|({{.|{||||||{|,|,{((((((((....,..{(({(,((({(((((....))))))))))))}{.{(((..{(((,,..{((.(((((((.{(((((((((...)))))))))}.))((((((.(((...)))(((((((((((((((((((((.{((.((((....)))).}}}{{{.....))}..(((.,,.((((.((((((..........(((((((.(((((((.......)))))))..((((({.....||||,,((((((((((((...((((,...,))))....)))))..)))))))....((((((((......,,|,.....,.((((((((((((............)))))))))))))))))))).,,||.}}}}......)))))}.......(((.....))).(((((((((({({{,,(((((((({(.{{|{{|.,..,{{({.............}}}}}{{{{,..,}))))}},..(((((((((.,(,,....,,),,)))))))))......||.}}}}.}}}},}}|(((((.....)))))}...|{|(({{{.||((((........)))).,...}})))))}))))))))))..)))))))....((((((((((((...}}}.))})))))))...)))))).)))).,,.)))..))))))))))).))))))..)))))))))){{{.....))}..((((......)))).))))))))|.)))}....)))}.}((((.((((((({,,((((....)))))))))}...{{{{,...|,,||{.((((......)))),|||,{,||,....||{|,||||{,,,{,.,,..(((.((({{,.((((.(((({{((((.......))))))))),)))).,})))}..)))))))),)})).,)).)))))))))))}}.|,|}}}}))))))}),,)}}}))))),,,))))).)))))))))))))))))))))))).......)))))}.,)))))),|||,|||||..|,{|||,..{{{{|,,,||..,|||}|||||||,...{((({....)))))..{(((.({(.((((((......{{....,}.....)))))).))))))}{(({{{.(({..{{{..{,.......((((((((((....)))))))))){(((.....))))}),})))..))))))))},......|||{{.,|||,|||{{{||....||||{{{{{,.||,,,}}.))})))})}),},,,,,...,,|||{((((((....,(({{.{{{|(({{(((({,.|||,{{{|||||,,.{{{{{.....((((((((,.(((((........{{{......)}}..,,,..(((...(.((((.....)))).)...))).,...{(((((((((((.....)))))))))))|((......)}}.))))).},)},})))))...(((((((...(((((...(.((((((({{,,{(((((((......))))))),......(((((.((((({,..............,{{.{((({...))))}.))))))).))))).,))}))))))).)...,,))))}.....)))))))...}}))).,||.((((((...,((((.,,.....,)))}.,.,...)))))).})))})))))).},}},))}.))))))}))}}))))))}}|||{,,||||}||,..,|||...|||||}},,,{|||.,,,..,)},))}}),,..,...}}}|,,,,.,......|}},|})}||,||||}||,.}}}}.))))}})))),,})))).,,,)))},.|||.}}||}}})),,...}},,},,}},.)))))}.})))).))))).))).))).)).))))..)))})}))))))).})))),)),)))})).,,,,,....,}}.)))))).))))).})))))))..{{{{,...|||||||{{|,,,,|||}}}||||{{{{....(((.(((((..({{..{{((((((({.....{{((((((.{(({,......))),))}})))))))))))).....}}..)))..))))))))...,}},}},))))){{(...((((((((((,.((((......)))).,.))},.,))))))....))},,,,,{,,{(({{......}}}}}..})},,.))))).)))..))))))..)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321729.2 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5922 nt 0.4478
NM_001321730.2 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5787 nt 0.4496
NM_001321731.2 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5963 nt 0.4473
NM_001321733.2 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5775 nt 0.4499
NM_001321734.2 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5756 nt 0.4486
NM_015189.3 NCBI
GUCGGCCUGCGGGUAGCCAGAGGCUGGGGCGGCUGUGGAGCCUGUGGUG… 5910 nt 0.4481
Summary

This gene encodes a protein which is a part of the evolutionarily conserved exocyst, a multimeric protein complex necessary for exocytosis, which in turn, is crucial for cell growth, polarity and migration. Disruption of this gene may be associated with phenotypes exhibiting multiple symptoms including intellectual disability and developmental delay (DD). [provided by RefSeq, Jun 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.