Basic Information

Symbol
EZR
RNA class
mRNA
Alias
Ezrin VIL2 Villin 2 (Ezrin) Cytovillin 2 P81 Epididymis Secretory Protein Li 105 Cytovillin HEL-S-105 Villin-2 CVIL CVL
Location (GRCh38)
6:158765741-158819413
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001111077.2
Sequence length
3052.0 nt
GC content
0.5072

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1048.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1103.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 702.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001111077.2 NCBI
ACUCGGCGGACGCAAGGGCGGCGGGGAGCACACGGAGCACUGCAGGCGC… 3052 nt 0.5072
NM_003379.5 NCBI
GAGUGUCGGGCGCGGCAGGAGGACGAGGCAGGGCGGGCGGGCGCUCUAA… 3069 nt 0.5073
Summary

The cytoplasmic peripheral membrane protein encoded by this gene functions as a protein-tyrosine kinase substrate in microvilli. As a member of the ERM protein family, this protein serves as an intermediate between the plasma membrane and the actin cytoskeleton. This protein plays a key role in cell surface structure adhesion, migration and organization, and it has been implicated in various human cancers. A pseudogene located on chromosome 3 has been identified for this gene. Alternatively spliced variants have also been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing pericontusional brain tissue from traumatic brain injury patients via cDNA microarray demonstrated that the EZR mRNA was up-regulated by 53% in a patient with cerebral infarction and by 93% in a TBI patient [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].